健康马皮肤单细胞RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1441223

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究构建了健康马皮肤的高质量单细胞RNA测序数据集，为阐明其细胞与转录图谱提供了参考。皮肤活检样本取自两匹临床健康马的鬃毛区域，设生物学重复，于4°C保存，并使用sCelLive组织解离试剂盒（皮肤）通过自动化和手动两种方案解离为单细胞悬液。细胞经过滤、活力评估后，加载至Singleron GEXSCOPE平台进行单细胞捕获和条形码标记。文库按照GEXSCOPE单细胞RNA文库试剂盒V2方案制备，并在Illumina NovaSeq X平台上以双端150 bp读长进行测序。原始测序数据经处理转换为FASTQ文件，并使用CeleScope流程比对至EquCab3.0参考基因组。该数据集为马皮肤生物学研究提供了基础资源，有助于与疾病状态进行比较，并推动免疫反应、组织稳态及皮肤病学条件的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。