E-MTAB-7032:最多66名个体人真皮成纤维细胞的bulk RNA-seq(补充)

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,内容为最多 66 名个体人真皮成纤维细胞的 bulk RNA-seq 补充数据

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基因组回归Differential
E-MTAB-7032: Bulk RNA-seq of of human dermal fibroblasts from up to 66 individuals (supplementary)

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

E-MTAB-7032:最多66名个体人真皮成纤维细胞的bulk RNA-seq(补充)

E-MTAB-7032 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens,内容为最多 66 名个体人真皮成纤维细胞的 bulk RNA-seq 补充数据。该数据集在站内归入皮肤与结缔组织疾病 / 其他分类,主题标签为 Differential,可用于了解人真皮成纤维细胞在不同个体间的转录组差异表达情况。整体而言,它提供了以个体为单位的批量转录组测序补充材料,适合作为皮肤与结缔组织相关研究中的表达数据参考。

【数据集背景】

该数据集属于 EBI Expression Atlas 中的差异表达实验(Differential)。Expression Atlas 是面向基因表达实验的公共资源,差异表达实验通常用于比较不同条件或分组之间的基因表达变化。E-MTAB-7032 聚焦于人类真皮成纤维细胞,真皮成纤维细胞是皮肤结缔组织中的主要细胞类型之一,其转录组特征与皮肤生理及结缔组织相关过程有关。该数据集以补充数据的形式提供,说明其定位是配合相关实验或研究提供额外的表达信息。源站未提供该实验的具体研究背景、实验目的及所比较的分组设计。

【数据内容】

数据内容为最多 66 名个体人真皮成纤维细胞的 bulk RNA-seq 数据,属于补充(supplementary)性质。Bulk RNA-seq 是对样本中混合细胞群体进行整体转录组测序的技术,可获得基因表达水平的批量测量结果。该数据集的主题标签为 Differential,表明其内容与差异表达分析相关。源站未提供具体的样本数量分布、测序平台、读长、基因注释版本、表达矩阵格式及差异分析结果等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所(EBI)的公共数据资源,具体为 Expression Atlas 实验条目。物种为 Homo sapiens,样本材料为人真皮成纤维细胞,个体数量最多为 66 名。源站未提供样本采集地点、采集时间、供体年龄与性别构成、伦理审批信息及测序实验的具体操作流程。

【适用场景】

该数据集可用于皮肤与结缔组织疾病 / 其他方向的研究参考,也可用于人真皮成纤维细胞转录组差异表达相关的方法学比较或表达特征观察。由于其为 bulk RNA-seq 补充数据,适合作为个体间表达差异分析的辅助材料,或用于与其他皮肤成纤维细胞表达数据进行比较研究。源站未提供该数据集的具体应用案例或验证结论。

【使用方法】

使用时应以 EBI Expression Atlas 中该实验条目的公开页面为入口,获取其提供的补充数据与相关说明。由于该数据集标注为差异表达实验,使用时可结合其差异表达主题进行分组比较或表达模式分析。源站未提供数据下载格式、文件组织方式、分析流程及软件参数等具体使用指引。

【质量与限制】

该数据集为补充数据,个体数量标注为“最多 66 名”,具体纳入分析的个体数及样本质量信息源站未提供。作为 bulk RNA-seq,其结果反映的是样本群体的整体表达水平,无法直接解析单细胞层面的异质性。源站未提供测序深度、数据质控指标、批次信息及差异表达显著性阈值等质量相关参数。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款。使用时应遵循 EBI Expression Atlas 及原始数据提供方的相关要求,具体引用信息与使用许可需以源站公开页面为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7032

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Bulk RNA-seq of of human dermal fibroblasts from up to 66 individuals (supplementary)

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