E-GEOD-41745:使用 RNA-seq 对银屑病进行转录谱分析揭示先前未鉴定的差异表达基因

数据内容为使用 RNA-seq 对银屑病进行转录谱分析,旨在揭示先前未鉴定的差异表达基因。覆盖皮肤疾病中的银屑病转录组层面,可用于研究银屑病相关基因表达变化、筛选差异表达基因,并支持皮肤疾病分子机制与生物标志物方向的探索(来源 ebi.ac.uk)

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基因组分类Differential
E-GEOD-41745: Transcriptional Profiling of Psoriasis Using RNA-seq Reveals Previously Unidentified Differentially Expressed genes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

E-GEOD-41745:使用 RNA-seq 对银屑病进行转录谱分析揭示先前未鉴定的差异表达基因

E-GEOD-41745 是一项围绕银屑病转录谱分析展开的基因表达数据集,全称为“Transcriptional Profiling of Psoriasis Using RNA-seq Reveals Previously Unidentified Differentially Expressed genes”。该数据集来自 ebi.ac.uk,属于表达图谱实验中的差异表达类型,研究对象为 Homo sapiens。其核心内容是利用 RNA-seq 技术对银屑病样本进行转录组层面的分析,目标在于发现此前未被识别的差异表达基因。数据集在分类上归属于皮肤疾病 / 其他,主题标签为 Differential,整体聚焦于银屑病相关基因表达变化,可为皮肤疾病分子机制研究、差异表达基因筛选以及生物标志物方向探索提供数据基础。

【数据集背景】

银屑病是一种涉及皮肤系统的疾病,其分子层面的变化需要通过转录组分析加以刻画。E-GEOD-41745 的英文名称明确指出,该数据集旨在通过 RNA-seq 对银屑病进行转录谱分析,并揭示先前未被识别的差异表达基因。这一背景说明该数据集并非泛泛的基因表达汇总,而是围绕银屑病这一具体皮肤疾病,针对差异表达基因发现这一目标而构建。来源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens,进一步表明其属于人类差异表达实验数据,服务于银屑病转录组层面的研究需求。

【数据内容】

该数据集的内容为使用 RNA-seq 对银屑病进行转录谱分析,重点在于揭示先前未鉴定的差异表达基因。其覆盖范围是皮肤疾病中的银屑病转录组层面,可用于研究银屑病相关基因表达变化、筛选差异表达基因,并支持皮肤疾病分子机制与生物标志物方向的探索。主题标签“Differential”表明该数据集的核心关注点是差异表达,而非单纯的表达谱展示。数据内容围绕银屑病样本的转录组展开,旨在通过 RNA-seq 手段识别在疾病状态下表达发生变化的基因,尤其是此前未被发现的差异表达基因。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述其为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。数据集英文名称为“E-GEOD-41745: Transcriptional Profiling of Psoriasis Using RNA-seq Reveals Previously Unidentified Differentially Expressed genes”。本站分类为皮肤疾病 / 其他,主题标签为 Differential。除上述来源与分类信息外,关于具体样本采集地点、采集时间、样本量、测序平台、建库方法、数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于银屑病转录组层面的研究,可用于分析银屑病相关基因表达变化,筛选差异表达基因,并支持皮肤疾病分子机制与生物标志物方向的探索。由于其为差异表达实验数据,研究者在关注银屑病中基因表达差异、寻找候选标志物或探索疾病相关分子通路时,可将该数据集作为参考来源之一。其皮肤疾病 / 其他分类也表明,该数据可被纳入更广泛的皮肤疾病转录组研究背景中使用。

【使用方法】

该数据集来自 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas experiment (Differential),属于差异表达类型。使用者可依据来源站提供的实验描述与差异表达分析结果,围绕银屑病转录组中的差异表达基因开展进一步研究。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置及复现步骤,源站未提供。因此,在实际使用时应以来源站发布的信息为准,结合差异表达实验的通用分析流程进行理解,但不应将通用流程视为该数据集的具体属性。

【质量与限制】

该数据集为 Expression Atlas 中的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,主题标签为 Differential,来源站为 ebi.ac.uk。其质量评估信息、样本规模、测序深度、重复数、统计阈值、批次效应处理情况、验证实验结果等,源站未提供。由于这些关键质量指标未在现有信息中体现,使用者在解释差异表达结果时需谨慎,并应参考来源站的原始记录以确认数据适用范围与局限性。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,英文名称为“E-GEOD-41745: Transcriptional Profiling of Psoriasis Using RNA-seq Reveals Previously Unidentified Differentially Expressed genes”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、作者贡献及版权声明,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应直接查阅来源站的相关说明,以获取准确的引用格式与许可信息。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-41745

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptional Profiling of Psoriasis Using RNA-seq Reveals Previously Unidentified Differentially Expressed genes

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