口腔鳞状细胞癌及其癌前病变口腔扁平苔藓的复发性染色体和表观遗传学改变数据集
该数据集包含通过微珠芯片技术获取的口腔鳞状细胞癌（OSCC）、其癌前病变口腔扁平苔藓（OLP）以及正常口腔黏膜组织的全基因组DNA甲基化数据和染色体改变信息，主要数据模态为表观遗传学数据和基因组学数据，用于研究OSCC的癌变机制、鉴定OLP作为前驱病变的分子证据，并探索口腔癌早期诊断的生物标志物和潜在治疗靶点。
基本信息
资源简介
口腔鳞状细胞癌及其癌前病变口腔扁平苔藓的复发性染色体和表观遗传学改变数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Recurrent chromosomal and epigenetic alterations in oral squamous cell carcinoma and its putative premalignant condition oral lichen planus》。配套论文《Recurrent chromosomal and epigenetic alterations in oral squamous cell carcinoma and its putative premalignant condition oral lichen planus》发表于 PLOS ONE（2019），DOI：10.1371/journal.pone.0215055。源站首次发布：2019-04-09。
【数据内容】
源站原始描述：Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) affects about 700.000 individuals per year worldwide with oral squamous cell carcinoma (OSCC) as a major subcategory. Despite a comprehensive treatment concept including surgery, radiation, and chemotherapy the 5-year survival rate is still only about 50 percent. Chronic inflammation is one of the hallmarks of carcinogenesis. Until now, little is known about the premalignant status of oral lichen planus (OLP) and molecular alterations in OLP are stil…
【数据结构与技术规格】
文件数 9 个，合计 15.34 MB。pone.0215055.s001.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，11.12 KB。pone.0215055.s002.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，535.34 KB。pone.0215055.s003.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，1.13 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0215055。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：cell carcinoma、bead chip approach、DNA methylation patterns、OLP、5- year survival rate、lichen planus Head、OSCC、DNA methylation pattern、HNSCC、alteration。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Recurrent_chromosomal_and_epigenetic_alterations_in_oral_squamous_cell_carcinoma_and_its_putative_premalignant_condition_oral_lichen_planus/7972436
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Németh, Christopher G.; Röcken, Christoph; Siebert, Reiner; Wiltfang, Jörg; Ammerpohl, Ole; Gassling, Volker (2019). Recurrent chromosomal and epigenetic alterations in oral squamous cell carcinoma and its putative premalignant condition oral lichen planus. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集研究头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的主要亚型——口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其潜在癌前病变口腔扁平苔藓（OLP）的分子机制。通过微珠芯片技术，对OSCC、OLP和正常口腔黏膜组织进行全基因组DNA甲基化分析和染色体改变检测。数据包含：OSCC特征性染色体改变模式、OLP与正常对照间的DNA甲基化差异模式、以及OLP与OSCC共享的表观遗传学改变。研究证实慢性炎症是致癌的关键因素，并首次系统揭示了OLP作为OSCC前驱病变的表观遗传学证据。主要应用于口腔癌早期诊断标志物发现、癌变机制研究和精准医疗策略开发。
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