IDR idr0141-sokol-skinmucosa 皮肤黏膜影像数据集(experimentA)

主题标签:皮肤与结缔组织疾病、黏膜疾病、细胞组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/黏膜疾病

idr
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图像皮肤与结缔组织疾病黏膜疾病细胞组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0141-sokol-skinmucosa (experimentA)

基本信息

模态
图像
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

IDR idr0141-sokol-skinmucosa 皮肤黏膜影像数据集(experimentA)

IDR idr0141-sokol-skinmucosa(experimentA)是图像数据资源(Image Data Resource,IDR)中收录的一项经策展的细胞与组织成像研究,主题聚焦于皮肤与结缔组织疾病以及黏膜疾病。该数据集在站内归入“皮肤与结缔组织疾病 / 黏膜疾病”分类,来源为 idr.openmicroscopy.org。作为 OME/EMBL-EBI 体系下经人工策展的成像研究,它属于实验 A(experimentA),共包含 2 幅图像。整体而言,该数据集规模精简,定位明确,适合作为皮肤、结缔组织与黏膜相关疾病成像研究的检索入口与参考样本,便于研究者了解该主题在 IDR 中的成像数据组织方式与可获取内容。

【数据集背景】

该数据集来源于图像数据资源 IDR,是其中编号为 idr0141-sokol-skinmucosa 的研究的 experimentA 部分。IDR 是由 OME 与 EMBL-EBI 共同维护的经策展细胞/组织成像研究资源,其收录的数据经过整理与标注,便于检索和复用。该研究以皮肤与结缔组织疾病、黏膜疾病为主题方向,属于临床与病理相关的组织/细胞成像范畴。本站将其归入“皮肤与结缔组织疾病 / 黏膜疾病”分类,与其主题标签一致。

【数据内容】

该实验包含 2 幅图像。源站将其描述为经策展的细胞/组织成像研究,属于 OME/EMBL-EBI 体系下的图像数据资源条目。除图像数量与所属研究外,源站未提供关于图像具体内容、成像模态、样本类型、染色方式、分辨率或通道构成的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源站为 idr.openmicroscopy.org,即图像数据资源 IDR。该研究在 IDR 中的标识为 idr0141-sokol-skinmucosa,实验标识为 experimentA。关于样本采集地点、采集时间、仪器设备与实验流程等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题分类,该数据集可用于皮肤与结缔组织疾病、黏膜疾病相关成像研究的检索、浏览与对照参考,也可作为了解 IDR 中此类研究数据组织形式的示例。由于图像数量有限,其更适合作为索引性、示例性资源,而非大规模分析或统计推断的数据基础。关于具体研究用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 IDR 站点(idr.openmicroscopy.org)按研究标识 idr0141-sokol-skinmucosa 及实验标识 experimentA 进行访问与浏览。关于图像下载格式、元数据字段、API 调用方式及具体分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 经策展收录的研究条目,具备资源层面的整理与标注。其主要限制在于图像数量仅为 2 幅,样本规模很小,难以支撑需要较大样本量的分析。关于图像质量、标注完整性及潜在偏差等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 IDR(OME/EMBL-EBI)。关于具体引用文献、作者信息及许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2451

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0141-sokol-skinmucosa. Experiment: experimentA. Images: 2. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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