黑色素瘤与黑色素细胞测序数据集
该数据集包含三个正常黑色素细胞原代培养物和三个黑色素瘤细胞系的RNA深度测序数据，数据模态为基因表达转录组测序数据，涵盖了不同RAF通路突变状态（如Braf V600E和N-ras Q61R）的样本，主要用于研究黑色素瘤的分子机制、IRES依赖性翻译调控的癌症新抗原识别，以及支持肿瘤免疫学和靶向治疗方向的分析。
基本信息
资源简介
黑色素瘤与黑色素细胞测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《melanoma and melanocytes sequencing》。源站首次发布：2025-03-16。
【数据内容】
源站原始描述：We performed RNA deep sequencing on poly-A RNAs from three normal melanocyte primary cultures and three melanoma cell lines. The three melanoma cell-lines were recently established from lymph node metastases of melanoma patients. In addition, in terms of mutations of the raf pathway, one cell-line was not mutated (M383), one had Braf V600E mutation (M305) and the last one harbored N-ras Q61R mutation (M315). Our primary objective was to identify cancer specific neoantigens whose expression is co…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 47.59 MB。数据集 DOI：10.17632/ntvc6bbffx.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/ntvc6bbffx
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/ntvc6bbffx
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个公开的医学研究数据集，通过对三个正常黑色素细胞原代培养物和三个黑色素瘤细胞系进行RNA深度测序（poly-A RNA）构建而成。数据集包含转录组测序数据，涵盖了黑色素细胞和黑色素瘤细胞的基因表达信息，其中黑色素瘤细胞系来源于黑色素瘤患者的淋巴结转移样本，并具有不同的RAF通路突变状态（包括Braf V600E突变、N-ras Q61R突变以及无突变样本）。数据来源于实验室测序实验，主要用于研究黑色素瘤的分子机制，特别是通过RNA-seq分析识别由IRES依赖性翻译调控的癌症特异性新抗原，支持肿瘤免疫学、基因表达调控和黑色素瘤靶向治疗等研究方向。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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