LEF1、CTNNB1和MITF-M结合MITF启动子

该数据集包含基于分子实验(如EMSA、ChIP和报告基因检测)的基因调控数据,主要模态为基因组和蛋白质互作信息,描述了转录因子LEF1、CTNNB1和MITF-M在MITF启动子上的结合机制及其在黑色素细胞发育和黑色素瘤进展中的作用,适用于研究WNT信号通路、黑色素细胞分化以及黑色素瘤的分子靶点探索。

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黑色素细胞发育黑色素瘤分子机制
LEF1, CTNNB1 and MITF-M bind the MITF promoter

基本信息

创建/更新时间
2026-09-25

资源简介

该数据集描述了WNT信号通路(特别是WNT3A和WNT1)在黑色素细胞发育和黑色素瘤进展中的分子机制,重点关注转录因子LEF1、CTNNB1(β-连环蛋白)和MITF-M(黑色素细胞特异性亚型)如何结合MITF基因的启动子区域以调控其表达。数据通过EMSA、ChIP和报告基因实验等分子生物学方法验证了LEF1结合位点对MITF-M表达的关键作用,并揭示了MITF与LEF1、CTNNB1的蛋白质相互作用及其在黑色素瘤细胞系中的剂量依赖性调控。该数据集主要用于研究黑色素细胞谱系发育、MITF自调控机制以及黑色素瘤的增殖与生存相关信号通路。

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使用方式

数据集获取

源站:https://reactome.org/PathwayBrowser/#/R-HSA-9824598

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集描述了WNT信号通路(特别是WNT3A和WNT1)在黑色素细胞发育和黑色素瘤进展中的分子机制,重点关注转录因子LEF1、CTNNB1(β-连环蛋白)和MITF-M(黑色素细胞特异性亚型)如何结合MITF基因的启动子区域以调控其表达。数据通过EMSA、ChIP和报告基因实验等分子生物学方法验证了LEF1结合位点对MITF-M表达的关键作用,并揭示了MITF与LEF1、CTNNB1的蛋白质相互作用及其在黑色素瘤细胞系中的剂量依赖性调控。该数据集主要用于研究黑色素细胞谱系发育、MITF自调控机制以及黑色素瘤的增殖与生存相关信号通路。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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