NCSTN敲低与NC HaCaT细胞转录组图谱
研究利用shRNA介导的基因敲低和RNA测序技术，检测NCSTN缺陷对HaCaT角质形成细胞中差异表达基因的影响，与化脓性汗腺炎（逆向痤疮）相关
基本信息
资源简介
NCSTN敲低与NC HaCaT细胞转录组图谱
transcriptome-wide map of NCSTN-KD and NC Hacat cells
该数据集为NCSTN基因敲低与阴性对照HaCaT细胞的转录组-wide图谱，来源于NCBI GEO（GSE209911），包含1个文件（GSE209911_series_matrix.txt.gz）。研究利用shRNA介导的基因敲低和RNA测序技术，检测NCSTN缺陷对HaCaT角质形成细胞中差异表达基因的影响，与化脓性汗腺炎（逆向痤疮）相关。数据可用于分析NCSTN缺失调控的基因表达变化，支持皮肤炎症性疾病机制研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 27 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：逆向痤疮（AI）是一种与nicastrin（NCSTN）突变相关的炎症性皮肤病。AI患者中已有常染色体显性遗传家族史的报道，并与γ-分泌酶亚基nicastrin（NCSTN）、presenilin enhancer 2（PSENEN）和presenilin-1（PSEN1）的突变相关。其中，NCSTN基因突变率最高。为了检测NCSTN缺陷对AI角质形成细胞的影响，本研究利用短发夹RNA（shRNA）介导的基因敲低和RNA测序技术，探索了HaCaT细胞中由NCSTN缺陷调控的差异表达基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：皮肤与结缔组织疾病/化脓性汗腺炎。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE209911
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 01 202，引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
反常性痤疮（AI）是一种与nicastrin（NCSTN）突变相关的炎症性皮肤病。已有报道称AI患者存在常染色体显性遗传的家族史，并与γ-分泌酶亚基nicastrin（NCSTN）、早老素增强子2（PSENEN）及早老素-1（PSEN1）的突变相关。其中，NCSTN基因的突变率最高。为检测NCSTN缺陷对AI角质形成细胞的影响，本研究采用短发夹RNA（shRNA）介导的基因敲低和RNA测序技术，探索了HaCaT细胞中由NCSTN缺陷调控的差异表达基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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