化脓性汗腺炎皮损皮肤转录组

源站描述指出,与健康供体皮肤相比,化脓性汗腺炎皮损皮肤转录组呈现特异性改变。数据可用于研究该疾病皮损的基因表达特征,并支持与健康皮肤的比较分析(来源 NCBI)

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基因组分类GPL203019606
GSE122592: Transcriptome of lesional skin of patients suffering from Acne inversa

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

化脓性汗腺炎皮损皮肤转录组

GSE122592 数据集收录了化脓性汗腺炎(Acne inversa)患者皮损皮肤的转录组数据,源站标题为“Transcriptome of lesional skin of patients suffering from Acne inversa”。根据源站描述,该数据集展示的皮损皮肤转录组与健康供体皮肤相比呈现特异性改变,可用于研究化脓性汗腺炎皮损的基因表达特征,并支持与健康皮肤的比较分析。数据集由 Ellen、Witte-Händel 提交,发布时间为 2019 年 11 月 15 日,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,在本站归类于皮肤与结缔组织疾病 / 化脓性汗腺炎方向。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE122592_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL20301 平台以及物种编号 9606。

【数据集背景】

化脓性汗腺炎是一种累及皮肤与结缔组织的疾病,本数据集聚焦于该疾病皮损部位的皮肤转录组。源站描述明确指出,化脓性汗腺炎皮损皮肤的转录组与健康供体皮肤相比存在特异性改变,这一表述构成了数据集的核心背景:通过比较患者皮损与健康供体皮肤的表达谱,可以观察疾病状态下皮肤转录活动的差异。数据集标题与源站标题一致,均强调“lesional skin”(皮损皮肤)与“Acne inversa”这一疾病对象,说明其取材部位和疾病指向明确。关于该疾病更详细的临床背景、样本纳入标准及研究动机,源站未提供。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE122592_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。从主题标签看,数据属于“Expression profiling by high throughput sequencing”,即基于高通量测序的表达谱分析,涉及平台编号 GPL20301 和物种编号 9606。源站描述表明数据反映的是皮损皮肤转录组相对于健康供体皮肤的特异性改变,因此数据内容的核心是基因表达层面的比较信息。关于具体样本数量、分组构成、检测基因数目、表达量单位及矩阵字段的详细定义,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Ellen、Witte-Händel,发布时间为 2019 年 11 月 15 日。数据集在本站归类于皮肤与结缔组织疾病 / 化脓性汗腺炎。源站描述仅说明皮损皮肤转录组与健康供体皮肤的比较关系,未提供样本采集部位的具体解剖描述、采集流程、测序平台运行细节或伦理审批信息,这些内容源站未提供。

【适用场景】

依据源站描述与侧写线索,该数据集可用于研究化脓性汗腺炎皮损的基因表达特征,并支持与健康皮肤的比较分析。具体而言,适合开展皮损与健康供体皮肤之间转录组差异的探索性分析,以及围绕高通量测序表达谱的基因层面研究。由于数据仅涉及皮损皮肤与健康供体的比较框架,不适用于其他疾病或非皮肤组织的推断。关于更具体的分析场景(如特定通路富集、标志物筛选等),源站未提供相应说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE122592_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码不一致导致分析偏差。由于数据集仅含 1 个文件,读取流程相对集中,但仍应遵循先核对后批量的原则。关于矩阵文件内具体列名、注释信息及配套元数据的解析方式,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅有 1 个文件,且源站描述较为简短,未提供样本量、测序深度、重复设置、质控指标或批次信息,因此无法据此评估数据的技术质量与统计效力。数据比较框架为皮损皮肤与健康供体皮肤,结论应限定在该比较范围内。关于数据是否存在缺失值、归一化方法及平台注释版本等细节,源站未提供。使用时应注意这些信息缺口,避免过度解读。

【引用与许可】

数据集作者为 Ellen、Witte-Händel,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 2019 年 11 月 15 日。关于该数据集的许可条款、使用限制及推荐引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE122592

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Transcriptome of skin from Acne inversa lesions show specific alterations compared to healthy donor skin.

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