Ncstn ΔKC小鼠与正常小鼠皮肤组织差异表达基因转录组测序
该数据集为Ncstn ΔKC小鼠与正常小鼠皮肤组织的转录组测序数据，用于分析差异表达基因。该数据可用于研究NCSTN在皮肤疾病（如化脓性汗腺炎）发病机制中的作用，支持差异表达基因筛选与分类分析（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
Ncstn ΔKC小鼠与正常小鼠皮肤组织差异表达基因转录组测序
GSE115100 数据集收录的是 Ncstn ΔKC 小鼠与正常小鼠皮肤组织的转录组测序数据，用于分析两组样本之间的差异表达基因。该数据依托角质形成细胞特异性 Ncstn 敲除小鼠模型，围绕 NCSTN 在人类 AI 发病机制中的作用展开研究，在分类上归入皮肤与结缔组织疾病 / 化脓性汗腺炎方向。数据集由 Yanyan，He 提交，来源为 ncbi.nlm.nih.gov，包含 1 个文件，样例文件为 GSE115100_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL21273 与物种编号 10090。整体而言，该数据集可用于差异表达基因筛选与分类分析，支持对 NCSTN 相关皮肤疾病发病机制的探索性研究。
【数据集背景】
该数据集对应的研究构建了角质形成细胞特异性 Ncstn 敲除小鼠（Ncstn ΔKC 小鼠），目的是考察 NCSTN 在人类 AI 发病机制中所扮演的角色。源站标题明确其为 Ncstn ΔKC 小鼠与正常小鼠皮肤组织的差异表达基因转录组测序。数据集在本站被归入皮肤与结缔组织疾病 / 化脓性汗腺炎分类，说明其应用语境与皮肤及结缔组织相关疾病的机制研究相关。研究以小鼠皮肤组织为对象，通过比较敲除模型与正常小鼠的转录组，为理解 NCSTN 功能缺失在皮肤组织中的分子后果提供数据基础。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE115100_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵形式的转录组测序表达数据。主题标签显示其数据类型为高通量测序表达谱分析（Expression profiling by high throughput sequencing），涉及平台 GPL21273，物种编号为 10090（小鼠）。数据内容对应 Ncstn ΔKC 小鼠与正常小鼠皮肤组织之间的差异表达基因分析，可用于比较两组样本的基因表达差异。除上述文件与标签信息外，源站未提供更细的样本数量、基因数量或具体差异基因列表等细节。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Yanyan，He，发布时间为 May 30 201。数据集英文名与源站标题一致，均为“Transcriptome sequencing of differentially expressed genes of the skin tissue of Ncstn ΔKC mice and normal mice”。源站描述说明研究通过构建角质形成细胞特异性 Ncstn 敲除小鼠来探究 NCSTN 在人类 AI 发病机制中的作用。样本材料为小鼠皮肤组织，检测方式为转录组测序。关于具体的测序平台仪器型号、建库流程、测序深度与试剂信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于差异表达基因筛选与分类分析，可用于比较 Ncstn ΔKC 小鼠与正常小鼠皮肤组织的转录组差异。结合其疾病分类，可用于研究 NCSTN 在皮肤疾病（如化脓性汗腺炎）发病机制中的作用，支持对 NCSTN 功能缺失相关分子通路的探索性分析。此外，该数据可作为皮肤与结缔组织疾病方向转录组研究的参考数据，用于方法学验证或与其他皮肤组织表达谱数据的对照分析。需要说明的是，上述用途均基于数据集的物种、组织与分组设计，具体分析结论需结合数据实际内容判断。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE115100_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式，需按对应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因编码或字段解析问题导致批量处理出错。读取后可依据样本分组信息区分 Ncstn ΔKC 小鼠与正常小鼠，进而开展差异表达分析。关于矩阵文件中具体的行名、列名与注释字段含义，源站未提供进一步说明，使用前应自行核对。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，规模较为有限，且源站未提供样本量、测序深度、重复数及质控指标等信息，难以据此评估数据的技术质量。数据来源于小鼠模型而非人类样本，将其结果外推到人类疾病时需谨慎。此外，源站未提供差异表达分析的具体统计方法与阈值设定，使用者在复现或比较分析时需自行确定分析参数。发布时间记录为 May 30 201，年份信息不完整，源站未提供更精确的日期说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Yanyan，He，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据的使用许可、引用格式与授权条款，源站未提供。使用者在引用或再分发数据前，应自行查阅源站的相关说明并遵循其要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115100
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们构建了角质形成细胞特异性Ncstn敲除小鼠，以探究NCSTN在人类AI发病机制中的作用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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