空间转录组学分析揭示慢性皮肤狼疮钙化中的成纤维细胞和炎症特征
该数据集是一个空间转录组学数据集,包含从慢性皮肤狼疮患者钙化组织切片中获取的空间分辨基因表达数据,通过空间转录组技术生成,能够同时分析基因表达和细胞空间位置,主要用于揭示皮肤狼疮钙化病变中成纤维细胞活化和炎症反应的分子机制,为研究疾病发病机制和寻找治疗靶点提供重要资源。
基本信息
资源简介
该数据集是一个空间转录组学数据集,用于研究慢性皮肤狼疮(CCLE)中钙化病变的分子特征。数据包含从患者组织切片获取的空间分辨基因表达信息,通过空间转录组技术(如10x Genomics Visium)生成,能够同时保留基因表达谱和细胞在组织中的空间位置信息。数据集主要揭示了钙化区域中成纤维细胞活化和炎症反应的分子特征,适用于研究皮肤狼疮的发病机制、组织微环境以及潜在的治疗靶点。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/zcf4fy9j65/1
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个空间转录组学数据集,用于研究慢性皮肤狼疮(CCLE)中钙化病变的分子特征。数据包含从患者组织切片获取的空间分辨基因表达信息,通过空间转录组技术(如10x Genomics Visium)生成,能够同时保留基因表达谱和细胞在组织中的空间位置信息。数据集主要揭示了钙化区域中成纤维细胞活化和炎症反应的分子特征,适用于研究皮肤狼疮的发病机制、组织微环境以及潜在的治疗靶点。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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