狼疮扩展表型队列结缔组织病患者血液RNA-seq
该数据集来自 EBI Expression Atlas，为狼疮扩展表型队列中结缔组织病供者血液的 RNA-seq 实验，物种为 Homo sapiens，属于差异表达类实验
基本信息
资源简介
狼疮扩展表型队列结缔组织病患者血液RNA-seq
E-MTAB-7080 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，全称为“RNA-seq of blood from donors with connective tissue diseases in the Lupus Extended Phenotype Cohort”。该数据集以 Homo sapiens（人类）为研究对象，对来自狼疮扩展表型队列中结缔组织病供者的血液样本进行 RNA-seq 测序，属于转录组层面的差异表达研究。在本站分类体系中，它归入“皮肤与结缔组织疾病 / 结缔组织疾病”方向，主题标签为“Differential”。整体而言，该数据集为研究结缔组织病（尤其是与狼疮相关的疾病表型）在外周血转录组中的差异表达特征提供了实验数据基础，适合用于基因表达比较分析与生物标志物探索等场景。
【数据集背景】
结缔组织病是一类累及结缔组织的自身免疫相关疾病，狼疮是其中的典型代表。狼疮扩展表型队列旨在从更广泛的表型谱系角度研究该类疾病。E-MTAB-7080 正是依托这一队列开展的 RNA-seq 差异表达实验，其设计目标是对比不同供者血液样本之间的基因表达差异，从而在转录组水平刻画疾病相关的变化。该数据集由 EBI Expression Atlas 收录，属于该平台中的 Differential 类实验。
【数据内容】
该数据集的核心内容是血液样本的 RNA-seq 表达数据，物种为 Homo sapiens。作为差异表达实验，其数据组织围绕组间表达比较展开，用于识别在不同供者群体之间表达水平存在差异的基因。源站将其标注为 Expression Atlas experiment (Differential)，主题标签为“Differential”。关于样本数量、分组细节、测序平台、读长、基因注释版本等具体参数，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 EBI Expression Atlas，来源站为 ebi.ac.uk。实验材料为狼疮扩展表型队列中结缔组织病供者的血液，采用 RNA-seq 技术获取转录组信息。该队列的招募标准、供者临床特征、样本采集与处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于结缔组织病相关的转录组差异表达研究，例如比较不同供者群体间外周血基因表达谱的差异、筛选候选差异表达基因、为后续生物标志物研究提供线索，也可作为 Expression Atlas 中同类自身免疫疾病表达实验的参照数据。由于数据来自血液样本，尤其适合关注外周血转录组变化的研究方向。具体可支持的统计比较设计，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 EBI Expression Atlas 平台访问与检索，用户可依据实验编号 E-MTAB-7080 定位该实验，并利用平台提供的差异表达结果进行查询与分析。关于下载格式、分析流程、配套工具及参数设置等操作细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 Expression Atlas 收录的差异表达实验，其质量评估信息、批次效应处理情况、样本排除标准等，源站未提供。使用时应注意，该数据仅覆盖狼疮扩展表型队列中的结缔组织病供者血液样本，结论外推到其他人群、其他组织或其他疾病类型时需谨慎。数据的具体局限性说明，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。使用者在发表研究成果或再分发数据前，应自行查阅 EBI Expression Atlas 及原始实验记录中的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7080
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表达图谱实验（差异表达）。物种：智人。狼疮扩展表型队列中结缔组织病供者血液的RNA-seq
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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