痤疮患者异维A酸治疗前及治疗1周后皮肤转录谱分析
该数据集来自 ebi.ac.uk,收录了 6 名接受 isotretinoin(13-cis 维A酸)治疗的痤疮患者皮肤活检样本的基因表达谱,分别于基线及治疗 1 周后取样,使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行转录谱分析

基本信息
资源简介
痤疮患者异维A酸治疗前及治疗1周后皮肤转录谱分析
Transcription profiling of human skin from patients with acne before and 1 week after isotretinoin (13-cis retinoic acid) treatment
该数据集来自 ebi.ac.uk,收录了 6 名接受 isotretinoin(13-cis 维A酸)治疗的痤疮患者皮肤活检样本的基因表达谱,分别于基线及治疗 1 周后取样,使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行转录谱分析。数据可用于研究 isotretinoin 治疗痤疮的分子机制,比较治疗前后基因表达变化,并识别差异表达基因,如源站描述中提到的 43 个显著变化基因(38 个上调、5 个下调)(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):痤疮的发病机制与多种因素有关,例如皮脂分泌增加、炎症、毛囊角化过度以及毛囊内 Propionibacterium acnes 的作用。13-cis 维A酸(13-cis RA,isotretinoin)是痤疮治疗中最有效的药物。令人意外的是,其在痤疮中的作用机制仍不清楚。为深入了解其作用机制,对 6 名接受 isotretinoin 治疗患者的皮肤进行了基因表达谱分析。在基线和 isotretinoin 治疗一周时获取患者皮肤活检样本。使用 Affymetrix HG-U133A 2.0 芯片进行基因芯片表达谱分析,以检查治疗导致的基因表达变化。治疗后,43 个基因发生显著变化:38 个上调,5 个下调。这些基因中有相当比例参与
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/痤疮。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-10433
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数据说明
E-GEOD-10433 痤疮患者接受异维A酸(13-顺式维A酸)治疗前及治疗1周后的人皮肤转录谱分析 通过微阵列进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 智人 痤疮的发病机制与多种因素有关,例如皮脂增加
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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