GSE186601:人类痤疮的Seq-Scope分析

源站描述指出皮肤样本通过Seq-Scope进行分析。该数据可用于人类痤疮皮肤样本的高通量测序表达谱研究(来源 NCBI)

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基因组GPL196049606
GSE186601: Seq-Scope analysis of human acne

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE186601:人类痤疮的Seq-Scope分析

GSE186601 是一个围绕人类痤疮皮肤样本开展的高通量测序表达谱数据集,英文全称为 Seq-Scope analysis of human acne,源站标题与英文名一致。该数据集归属于皮肤与结缔组织疾病下的痤疮方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。按照源站描述,相关皮肤样本通过 Seq-Scope 技术进行分析,因而该数据可用于人类痤疮皮肤样本的高通量测序表达谱研究。数据集目前包含 1 个文件,样例文件为 GSE186601_series_matrix.txt.gz,作者为 Jer-En,Hsu,发布时间标注为 Oct 26 202。整体来看,这是一个聚焦痤疮皮肤组织、以测序表达谱为核心内容的小型数据集,适合作为相关研究的表达谱数据来源加以查阅和利用。

【数据集背景】

该数据集面向皮肤与结缔组织疾病中的痤疮研究。痤疮是常见的皮肤疾病,涉及皮肤组织的基因表达变化,而表达谱数据能够从转录层面反映样本中的基因活动情况。源站描述说明,皮肤样本通过 Seq-Scope 进行分析,这构成了该数据集的基本技术背景。数据集的主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL19604 和 9606,分别指向高通量测序表达谱、对应的平台编号以及人类这一物种信息。这些信息共同表明,该数据集关注的是人类痤疮皮肤样本在测序层面的表达特征,可为痤疮相关的皮肤生物学研究提供数据基础。

【数据内容】

数据集当前包含 1 个文件,样例文件名为 GSE186601_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。从文件命名来看,其内容以系列矩阵形式组织,通常用于承载样本层面的表达谱信息。源站未提供该文件内部的具体字段构成、样本数量、基因数量以及表达值类型等细节,因此无法进一步说明其数据表的行列含义。主题标签中的 GPL19604 指向所使用的测序平台编号,9606 指向人类物种分类,Expression profiling by high throughput sequencing 则说明数据属于高通量测序表达谱类型。除上述信息外,源站未提供更多关于数据内容粒度的描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 Seq-Scope analysis of human acne。按照源站描述,皮肤样本通过 Seq-Scope 进行分析,说明样本材料为人类皮肤组织,分析手段为 Seq-Scope。数据作者为 Jer-En,Hsu,发布时间标注为 Oct 26 202。源站未提供样本采集的具体部位、采集人数、伦理审批信息以及测序过程的详细参数,因此这些方面无法在本介绍中展开。可以确认的是,数据由 NCBI 站点发布,并以系列矩阵文件的形式对外提供。

【适用场景】

基于源站描述与主题标签,该数据集适用于人类痤疮皮肤样本的高通量测序表达谱研究。研究者可以将其作为痤疮皮肤组织表达层面的数据来源,用于了解该疾病相关样本的转录谱特征。由于数据归属皮肤与结缔组织疾病方向,也可在皮肤疾病相关的表达谱比较或方法学探索中作为参考数据使用。主题标签中的高通量测序表达谱类型表明,其适合与测序表达分析相关的工作流程配合使用。源站未提供该数据集在具体研究中的既定用途或已验证的分析结论,因此上述场景仅依据数据类型与疾病分类作出的一般性说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE186601_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取前需按相应格式进行解压或直接以支持 GZIP 的工具打开。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于源站未提供文件内部的字段说明,实际读取时应以文件自身内容为准,逐项确认列名、样本标识与表达值的组织方式。对于系列矩阵文件,通常需要结合平台信息理解表达值的含义,平台编号 GPL19604 可作为对照依据。源站未提供配套的分析脚本、注释文件或标准化流程,使用时应根据自身研究目的自行设计处理步骤。

【质量与限制】

该数据集目前仅包含 1 个文件,规模较小,源站未提供样本量、测序深度、数据完整性以及质量控制指标等信息,因此无法对其数据质量作出具体评价。源站描述较为简短,仅说明皮肤样本通过 Seq-Scope 进行分析,未提供实验设计、重复设置与批次信息,这限制了对数据可靠性与可比性的判断。此外,发布时间标注为 Oct 26 202,年份信息不完整,源站未提供更精确的发布或更新记录。使用者在依赖该数据得出结论前,应自行核查文件内容与字段含义,并注意源站未提供许可条款、使用限制与引用规范等说明。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Jer-En,Hsu,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 Seq-Scope analysis of human acne。引用时应依据源站提供的作者与标题信息进行标注。源站未提供具体的许可协议、使用条款以及推荐的引用格式,因此无法在本介绍中给出许可范围或正式引用模板。使用者在公开引用或再分发该数据前,应前往来源站查阅相关说明,以确认适用的引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186601

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Skin samples were analyzed through Seq-Scope.

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