痤疮患者皮损与非皮损皮肤活检单细胞RNA-seq数据
该数据集为痤疮患者皮损（丘疹）与非皮损皮肤活检的单细胞RNA-seq数据，来自6例患者，皮损皮肤共32,966个细胞、非皮损皮肤共29,202个细胞，使用10X Genomics平台
基本信息
资源简介
痤疮患者皮损与非皮损皮肤活检单细胞RNA-seq数据
Single cell RNA-seq data comparing lesional (papules) and non-lesional skin biopsies of acne patients
该数据集为痤疮患者皮损（丘疹）与非皮损皮肤活检的单细胞RNA-seq数据，来自6例患者，皮损皮肤共32,966个细胞、非皮损皮肤共29,202个细胞，使用10X Genomics平台。数据经UMAP降维投影，无监督聚类得到8个主要聚类，对应淋巴细胞、髓系细胞、角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞、平滑肌细胞和黑素细胞7种细胞类型。可用于痤疮皮损与非皮损皮肤细胞组成和基因表达差异分析，以及细胞类型分类研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：May 30 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用10X Genomics对六名痤疮患者的皮肤活检进行了单细胞RNA测序分析，皮损皮肤共32,966个细胞，非皮损皮肤共29,202个细胞。来自皮损和非皮损皮肤细胞的基因表达数据经比对后，使用UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）投影到二维空间。无监督聚类揭示了八个主要聚类，对应七种不同的细胞类型：淋巴细胞、髓系细胞、角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞、平滑肌细胞和黑素细胞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：皮肤与结缔组织疾病/痤疮。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE175817
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 19 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE175817
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用10X Genomics对六名痤疮患者的皮肤活检样本进行了单细胞RNA测序分析，共获得病变皮肤32,966个细胞和非病变皮肤29,202个细胞。来自病变和非病变皮肤细胞的基因表达数据经过比对，并使用UMAP（统一流形近似与投影）投射到二维空间。无监督聚类揭示了八个主要聚类，对应于七种不同的细胞类型：淋巴细胞、髓系细胞、角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞、平滑肌细胞和黑素细胞。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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