小鼠与人皮肤NCSTN突变与否的差异表达基因转录组测序

该数据集为GSE115101超级系列,包含小鼠与人皮肤在有或无NCSTN突变条件下的转录组测序数据,用于差异表达基因分析

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基因组分类GPL207959606
GSE115101: Transcriptome sequencing of differentially expressed genes in mouse and human skin with and without NCSTN mutation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

小鼠与人皮肤NCSTN突变与否的差异表达基因转录组测序

GSE115101 是一个聚焦于皮肤转录组差异表达分析的公共数据集,其英文全称为 Transcriptome sequencing of differentially expressed genes in mouse and human skin with and without NCSTN mutation,即针对携带与不携带 NCSTN 突变的小鼠皮肤和人皮肤开展差异表达基因研究的转录组测序数据。该数据集由 NCBI 收录,在本站归入皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮分类,作者为 Yanyan,He,发布时间为 May 30 201。数据集以超级系列(SuperSeries)的形式组织,当前提供 1 个数据文件,样例文件名为 GSE115101_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集可用于观察 NCSTN 基因突变背景下皮肤组织基因表达谱的变化,为相关皮肤疾病机制研究提供转录层面的数据基础。

【数据集背景】

NCSTN 是本研究关注的核心基因,数据集的设计围绕“有或无 NCSTN 突变”这一对照条件展开,并同时覆盖小鼠与人类两种来源的皮肤样本。源站标题明确表明该数据集是对小鼠和人皮肤中差异表达基因的转录组测序,因此其研究背景与皮肤组织在 NCSTN 突变状态下的基因表达改变相关。本站将其归入皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮分类,说明该数据在站内被组织到皮肤疾病相关主题之下。源站描述指出,该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,表明其结构上是一个整合多个子系列的上层数据集。

【数据内容】

数据集当前提供 1 个文件,样例为 GSE115101_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing,说明数据来源于高通量测序的表达谱分析;标签中还出现 GPL20795 与 9606,分别对应平台与物种相关的标识信息。结合标题与短描述,数据内容涵盖小鼠皮肤与人皮肤在 NCSTN 突变存在与否条件下的转录组测序结果,并用于差异表达基因分析。除上述信息外,源站未提供更细的样本数量、分组规模或基因列表等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 平台收录的公共数据资源,作者为 Yanyan,He,发布时间为 May 30 201。数据以 SuperSeries 形式发布,源站描述说明其由若干 SubSeries 组成。关于样本采集地点、伦理审批、测序平台的具体型号与测序策略等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于皮肤转录组层面的差异表达研究,尤其是围绕 NCSTN 突变对小鼠与人类皮肤基因表达影响的比较分析。由于同时涉及小鼠和人两种物种,可用于跨物种的表达谱对照观察;结合本站的皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮分类,也可作为相关皮肤疾病机制探索的公共数据参考。具体分析目标需依据使用者自身研究设计确定,源站未提供推荐的分析流程或结论。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE115101_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包的格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,若需追溯具体子系列内容,可依据源站描述中“由下列 SubSeries 组成”的说明在源站进一步查找。源站未提供其他使用步骤或软件要求。

【质量与限制】

该数据集仅提供 1 个文件,样例为系列矩阵压缩包,源站未提供原始测序数据、样本元数据明细或质控指标等信息,因此难以仅凭现有信息评估数据质量。源站描述较为简略,仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries。发布时间记录为 May 30 201,年份信息不完整。使用时应以源站实际内容为准,源站未提供关于数据完整性、批次效应或技术偏差的说明。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。使用该数据集时,建议遵循 NCBI 来源站的相关使用政策,并依据源站页面获取正式引用信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115101

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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