痤疮丙酸杆菌的比较基因组学与转录组学研究
该数据集包含痤疮丙酸杆菌多个菌株的基因组和转录组测序数据，涵盖基因序列和基因表达量等分子模态，通过比较分析揭示了不同菌株在基因组结构和生长阶段特异性基因表达上的差异，主要用于研究该细菌在痤疮等皮肤炎症性疾病中的致病机制、毒力因子功能以及皮肤微生物组的生态与进化关系。
基本信息
资源简介
痤疮丙酸杆菌的比较基因组学与转录组学研究
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Comparative Genomics and Transcriptomics of Propionibacterium acnes》。配套论文《Comparative Genomics and Transcriptomics of Propionibacterium acnes》发表于 PLoS ONE（2011），DOI：10.1371/journal.pone.0021581。源站首次发布：2011-06-27。
【数据内容】
源站原始描述：The anaerobic Gram-positive bacterium Propionibacterium acnes is a human skin commensal that is occasionally associated with inflammatory diseases. Recent work has indicated that evolutionary distinct lineages of P. acnes play etiologic roles in disease while others are associated with maintenance of skin homeostasis. To shed light on the molecular basis for differential strain properties, we carried out genomic and transcriptomic analysis of distinct P. acnes strains. We sequenced the genome of…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 546.82 KB。Figure_S1.doc：application/msword，186.37 KB。Table_S1.doc：application/msword，61.95 KB。Table_S2.xls：application/vnd.ms-excel，116.74 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0021581。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics、Microbiology。主题标签：comparative、genomics、transcriptomics。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics、Microbiology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Comparative_Genomics_and_Transcriptomics_of_Propionibacterium_acnes_/135614
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Brzuszkiewicz, Elzbieta; Weiner, January; Wollherr, Antje; Thürmer, Andrea; Hüpeden, Jennifer; B. Lomholt, Hans; et al. (2016). Comparative Genomics and Transcriptomics of Propionibacterium acnes. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集聚焦于人类皮肤共生菌——痤疮丙酸杆菌（Propionibacterium acnes）的比较基因组学与转录组学分析。数据集包含多个P. acnes菌株（如266、KPA171202等）的基因组测序数据、转录组测序数据以及比较分析结果。通过基因组比对，揭示了不同系统发育型菌株之间的基因组差异，特别是与毒力因子和适应性状相关的岛状区域；通过转录组分析，比较了不同菌株在指数生长期和稳定期的基因表达差异，涉及转运系统、代谢途径、毒力因子（如硫酸皮肤素黏附素、脂酶GehA等）以及生长阶段相关的应激反应和氨基酸代谢基因。数据来源于实验室测序与生物信息学分析，主要应用于病原体功能基因组学、皮肤微生物组研究，尤其用于探索P. acnes菌株在痤疮等炎症性疾病中的致病机制与皮肤稳态维持的分子基础。
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