结核分枝杆菌北京B0/W148簇蛋白质组分析

该项目旨在研究结核分枝杆菌感染期间的基本生理状态,以及感染宿主组织人肺中的分枝杆菌反应,并通过高通量蛋白质组分析MTB细胞

pride
2016-07-06 更新
浏览 15
蛋白质分类TuberculosisMtbBeijingLc-ms/ms
PXD002542: Proteome analysis of the M. tuberculosis Beijing B0/W148 cluster

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2016-07-06

资源简介

结核分枝杆菌北京B0/W148簇蛋白质组分析

该项目旨在研究结核分枝杆菌感染期间的基本生理状态,以及感染宿主组织人肺中的分枝杆菌反应,并通过高通量蛋白质组分析MTB细胞。主要新颖性在于描述直接从结核患者临床材料提取的MTB细胞蛋白质表达模式;描述体外MTB菌株蛋白质组特征的中间结果也对全球科学界重要。相关标签包括结核病、Mtb、Beijing、LC-MS/MS、多种结核分枝杆菌及H37Rv、TripleTOF 5600(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目的主要目的是研究结核分枝杆菌(M. tuberculosis,MTB)在感染过程中的基础生理状态,以及分枝杆菌在受感染宿主组织——人肺内的反应。为解决这一问题,将采用针对MTB细胞的高通量蛋白质组学分析。对直接从结核病患者临床材料中提取的MTB细胞所表达的蛋白质模式进行描述,是本项目的主要创新之处。毫无疑问,描述MTB菌株体外蛋白质组特征的项目阶段性结果,对全球科学界也将至关重要。

【主题与分类】

主题标签:Tuberculosis、Mtb、Beijing、Lc-ms/ms。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002542

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目的主要目的是研究结核分枝杆菌(M. tuberculosis,MTB)在感染过程中的基础生理状态,以及分枝杆菌在受感染宿主组织——人肺内的反应。为解决这一问题,将采用针对MTB细胞的高通量蛋白质组学分析。对直接从结核病患者临床材料中提取的MTB细胞所表达的蛋白质模式进行描述,是本项目的主要创新之处。毫无疑问,描述MTB菌株体外蛋白质组特征的项目阶段性结果,对全球科学界也将至关重要。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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