PRJNA1397972：Aspergillus fumigatus 原始序列读段
该数据集为一名确诊肺曲霉球患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）宏基因组二代测序（mNGS）数据，患者有类风湿关节炎（接受免疫抑制生物制剂 tocilizumab 治疗）及肺结核病史
基本信息
资源简介
PRJNA1397972：Aspergillus fumigatus 原始序列读段
该数据集为一名确诊肺曲霉球患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）宏基因组二代测序（mNGS）数据，患者有类风湿关节炎（接受免疫抑制生物制剂 tocilizumab 治疗）及肺结核病史。数据包含 Illumina 双端测序读段，旨在支持免疫抑制宿主罕见真菌感染的病原学诊断，并展示 mNGS 在临床环境中鉴定 Aspergillus fumigatus 的应用。该数据可作为真菌病原体检测、免疫抑制个体宿主-微生物互作及临床标本中 Aspergillus 分离株基因组研究的资源（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本项目呈现了从一名诊断为肺曲霉球患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）中产生的宏基因组二代测序（mNGS）数据。该患者具有复杂的病史，包括类风湿关节炎（接受免疫抑制生物制剂 tocilizumab 治疗）和肺结核病史。这些数据旨在支持对免疫抑制宿主中罕见真菌感染的病原学诊断，并展示 mNGS 在临床环境中鉴定 Aspergillus fumigatus 的应用。该数据集包含 Illumina 双端测序读段，可作为真菌病原体检测、免疫抑制个体中宿主-微生物互作以及临床标本中 Aspergillus 分离株基因组研究的资源。
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1397972
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1397972
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目展示了从一名诊断为肺曲霉球的患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）中产生的宏基因组下一代测序（mNGS）数据。该患者具有复杂的病史背景，包括类风湿关节炎（接受免疫抑制生物制剂托珠单抗治疗）和肺结核病史。这些数据的产生旨在支持对免疫受损宿主中一种罕见真菌感染的病原学诊断，并展示mNGS在临床环境中鉴定烟曲霉的应用。该数据集包含Illumina双端测序reads，可作为真菌病原体检测、免疫受损个体中宿主-微生物相互作用以及临床标本中曲霉分离株基因组研究的资源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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