基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1047645：宿主导向疗法改善结核病结局

PRJNA1047645: Host-directed therapies improve tuberculosis outcomes 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目数据集，编号为 1047645。该数据集围绕宿主导向疗法改善结核病结局这一主题组织，在分类上归属于呼吸系统疾病中的肺结核方向。其数据主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），意味着该项目关联的数据类型以测序产生的原始读段为主。作为一个 BioProject 记录，它本身并不直接承载全部实验数据，而是作为一个入口，将围绕同一研究目标产生的多种类型数据集中关联起来，便于使用者在一个位置检索和获取相关数据。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于公共生物数据资源的一部分。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，围绕同一项研究倡议展开，并为用户提供一个统一的位置，以查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集即属于此类项目记录，其研究主题聚焦于宿主导向疗法与结核病结局之间的关系。结核病属于呼吸系统疾病范畴，因此该数据集在分类上被归入呼吸系统疾病 / 肺结核方向。通过 BioProject 的组织形式，研究者可以围绕“宿主导向疗法改善结核病结局”这一目标，定位到与之相关的测序数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），说明其关联的数据内容以测序原始读段为主。原始序列读段通常是高通量测序平台直接输出的数据形式，可作为后续比对、定量、变异检测等分析的起点。除这一主题标签外，关于具体样本数量、测序平台、读长、物种来源、实验条件、分组设计等信息，源站未提供。因此，本数据集在内容层面可确认的核心信息是：它属于一个以宿主导向疗法改善结核病结局为主题的项目，并关联原始序列读段类型的数据。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1047645。BioProject 记录本身由单一机构或联合体发起，用于汇集同一研究倡议下的多种数据类型。关于本项目的具体提交机构、联合体组成、样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体的实验流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要围绕宿主导向疗法与结核病结局这一主题查找相关生物数据的场景。由于其为 BioProject 记录，使用者可将其作为入口，定位该项目关联的原始序列读段及其他可能的数据类型。其分类归属为呼吸系统疾病 / 肺结核，因此也适合肺结核相关研究者在检索公共数据资源时作为参考。关于该数据集是否适用于特定分析流程、能否直接用于临床决策或药物开发等具体用途，源站未提供相应说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1047645 进行检索，进入该项目的记录页面。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供一个统一位置，以查找该项目产生的多种数据类型。因此，使用者可从该记录出发，进一步访问其关联的数据资源，包括主题标签所指示的原始序列读段。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具推荐以及配套的元数据字段，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集作为 BioProject 记录，其主要功能是项目级的数据组织与索引，而非直接提供完整的实验细节或分析结论。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、样本完整性、批次效应、污染控制等信息，源站未提供。此外，关于该数据集是否存在使用限制、是否经过同行评审、是否有配套发表文献等，源站未提供。使用者在利用该数据集时，应结合其原始项目页面中的实际数据与元数据自行判断适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用协议以及是否需要注明来源等具体信息，源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集，应参考 NCBI BioProject 记录页面及相关数据资源所附带的说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1047645

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1047645

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

宿主导向疗法（HDTs）为结核病（TB）感染期间通过化疗清除细菌提供了替代途径。此批量RNA-Seq数据集旨在探索与HDT治疗相关的基因表达变化，涵盖了多种条件，包括未感染和感染结核的肺组织，以及兔（Oryctolagus cuniculus）中的肉芽肿。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别