CNFY毒素诱导炎症缺失驱动假结核耶尔森菌持续感染

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Loss of CNF_Y toxin-induced inflammation drives <i>Yersinia pseudotuberculosis</i> into persistency
• DOI：10.1371/journal.ppat.1006858
• 发布日期：2018-02-01
• 文件数：17 个
• 文件总体积：51.86 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Loss_of_CNF_sub_Y_sub_toxin-induced_inflammation_drives_i_Yersinia_pseudotuberculosis_i_into_persistency/5847876

命令行下载

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文件清单

• ppat.1006858.s001.tif（294.52 KB）
• ppat.1006858.s002.tif（589.71 KB）
• ppat.1006858.s003.tif（886.61 KB）
• ppat.1006858.s004.tif（1.11 MB）
• ppat.1006858.s005.tif（1.00 MB）
• ppat.1006858.s006.tif（998.16 KB）
• ppat.1006858.s007.tif（744.54 KB）
• ppat.1006858.s008.tif（620.82 KB）
• ppat.1006858.s009.docx（81.11 KB）
• ppat.1006858.s010.docx（107.41 KB）
• ppat.1006858.s011.docx（122.27 KB）
• ppat.1006858.s012.xls（12.70 MB）
• ppat.1006858.s013.xls（8.69 MB）
• ppat.1006858.s014.xls（5.41 MB）
• ppat.1006858.s015.xls（6.70 MB）
• ppat.1006858.s016.xls（5.82 MB）
• ppat.1006858.s017.xls（5.97 MB）

文件总体积 51.86 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

由肠道耶尔森菌引起的胃肠道感染可持续存在，并因复发性肠炎和严重的自身免疫性疾病而变得复杂。为建立持续性感染，细菌在穿过肠上皮并定植于其下的肠相关淋巴组织时，必须应对恶劣的环境。细菌如何在宿主免疫反应面前站稳脚跟，目前知之甚少。在此，我们表明，CNFY毒素——该毒素增强抗吞噬Yop效应子的转位——诱导炎症反应。这导致广泛的组织破坏、肠道微生物群改变和细菌清除。然而，抑制CNFY功能会增加干扰素-γ介导的反应，包括非炎症性抗菌活性和免疫耐受。这一过程伴随着病原体转录反应向持续性状态的提前重编程，这赋予细菌对抗宿主反应的适应优势，并促进共生型生活方式的建立。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.ppat.1006858（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Loss_of_CNF_sub_Y_sub_toxin-induced_inflammation_drives_i_Yersinia_pseudotuberculosis_i_into_persistency/5847876）。