适配器通过改变构象采样驱动依赖环境的结核分枝杆菌ClpX活性
研究聚焦结核分枝杆菌ClpX与适配器SSB和SmpB的相互作用,揭示适配器对ClpX活性的调控机制。该数据可用于分析基因表达变化,支持ClpX功能及适配器依赖调控的预测研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
适配器通过改变构象采样驱动依赖环境的结核分枝杆菌ClpX活性
Adapters drive context-dependent Mycobacterial ClpX activity by altering conformational sampling
该数据集来自NCBI GEO,标题为“Adapters drive context-dependent Mycobacterial ClpX activity by altering conformational sampling”,属于呼吸系统疾病/肺结核分类。数据包含1个文件(GSE240561_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序的表达谱分析,平台为GPL29178,物种编号83332。研究聚焦结核分枝杆菌ClpX与适配器SSB和SmpB的相互作用,揭示适配器对ClpX活性的调控机制。该数据可用于分析基因表达变化,支持ClpX功能及适配器依赖调控的预测研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):AAA+ ATP酶ClpX识别多种底物并在细胞稳态中发挥关键作用。结核分枝杆菌(Mtb)ClpX与两个结构不同的适配器结合——单链DNA结合蛋白(SSB)和小蛋白B(SmpB)。适配器依赖的ClpX活性调节的机制特征及其功能意义仍知之甚少。结果表明,两个适配器均与ClpX的N端结构域结合,但化学计量不同。SSB结合增强ATP酶活性,而SmpB则不增强。结构和生化实验揭示,两个适配器均大幅减少构象采样,并驱动ClpX进入更紧凑、更均匀的四级排列。适配器与ClpX的相互作用组指示了区分适配器依赖与适配器非依赖ClpX活性的特征。e的变化
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL29178、83332。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240561
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 09 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
AAA+ ATP酶ClpX能够识别多种底物,在细胞稳态中发挥关键作用。结核分枝杆菌(Mtb)ClpX与两种结构不同的衔接蛋白结合——单链DNA结合蛋白(SSB)和小蛋白B(SmpB)。衔接蛋白依赖性调节ClpX活性的机制特征及其功能意义仍知之甚少。结果表明,两种衔接蛋白均与ClpX的N端结构域结合,但化学计量比不同。SSB结合可增强ATP酶活性,而SmpB则不能。结构和生化实验揭示,两种衔接蛋白均大幅减少构象采样,并驱动ClpX形成更紧凑、更均一的四元排列。衔接蛋白与ClpX的相互作用组揭示了区分衔接蛋白依赖性与非依赖性ClpX活性的特征。过表达SSB或SmpB后Mtb细胞表达谱的变化提示蛋白质回收机制与转录之间存在功能联系。
因此,Mtb ClpX 既是一种驱动蛋白质成熟的解折叠酶,又是一种在该缓慢生长的人类病原体中协调转录与翻译过程的检查点调节因子。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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