脊柱结核基因表达谱

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05610098

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：结核，脊柱，结核，骨关节，结核，分枝杆菌感染，感染，骨疾病，感染性，肌肉骨骼疾病，脊柱疾病。在脊柱结核X队列中，研究者旨在利用全身PET/CT描述脊柱结核的临床表型，并识别不同播散阶段的特定基因表达谱，并将发现与先前描述的潜伏性和活动性肺结核特征进行比较。基于血液的脊柱结核检测将在全球所有环境下促进更早的诊断和治疗，并改善这种毁灭性疾病的治疗结果。1. 研究者假设脊柱结核可能表现为两种临床表型：孤立的脊柱结核，全身PET/CT上无其他病变；以及播散性脊柱结核，全身PET/CT上除脊柱病变外还有额外的脊柱外病变。2. 研究者假设特定的基因表达谱可能区分上述两种临床实体，并允许在抗菌治疗期间进行治疗效果监测（“个性化医疗”）3.

研究者假设全身PET/CT在诊断脊柱及脊柱外结核方面优于MRI。主要目的：利用全身PET/CT描述脊柱结核的临床表型，并鉴定按HIV状态分层的孤立性脊柱结核与播散性脊柱结核的mRNA基因表达谱。次要目的：1. 利用MRI和PET/CT两种影像学手段，识别疑似脊柱结核的分布模式。2. 分析从身体不同部位提取的结核分枝杆菌（Mtb）基因组（如可获得），并鉴定其在单核苷酸多态性（SNPs）及药物敏感性方面的基因组差异。3. 分析治疗开始时、6个月及12个月时的PET/CT影像学表现，以更好地通过PET/CT理解治疗结局。4. 比较基线下PET/CT与MRI的影像学表现，以评估PET/CT在脊柱结核诊断中的作用（虚拟活检）。设计：这是一项前瞻性队列研究，旨在开发针对孤立性脊柱结核与播散性脊柱结核的新诊断方法及治疗监测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。