南非实施Xpert MTB/RIF后耐药结核治疗前延误与失访的回顾性队列研究数据

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.051h0

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数据集大小约 385.9 KB。

数据说明

背景：南非耐利福平结核病（RR-TB）负担沉重，2014年诊断患者达18，734例。随着Xpert MTB/RIF检测的引入——该检测用于所有疑似结核病患者的诊断——诊断患者数量大幅增加。常规汇总数据显示，实验室确诊的RR-TB患者数量与报告已开始二线治疗的患者数量之间存在较大的治疗缺口（治疗前失访）。我们旨在评估南非全国范围内Xpert MTB/RIF实施对RR-TB二线治疗启动延迟及治疗前失访的影响。方法与结果：开展了一项全国性回顾性队列研究，以评估实验室诊断的RR-TB患者中二线治疗的启动情况及治疗延迟。队列纳入南非每个省份约300例连续诊断的RR-TB患者，分别取自2011年和2013年，即Xpert实施前后。6个月内曾有实验室RR-TB诊断的患者及正在接受治疗的患者被排除在外。

治疗启动情况通过与国家和地方治疗登记系统的数据链接、病历审查、医护人员访谈以及与患者或家庭成员的直接联系来确定。额外的实验室数据用于追踪病例。全国治疗启动百分比和至治疗时间的估计值经过加权处理，以考虑抽样设计。2011年和2013年队列分别有2，508例和2，528例符合条件的患者；92%为新诊断的RR-TB（新发RR-TB，既往无RR-TB诊断）。在全国范围内，2011年和2013年队列中分别有2，340例和2，311例新发RR-TB患者，其中55%（95% CI 53-57）和63%（95% CI 61-65）在诊断标本送检后6个月内开始治疗（p<0.001）。然而，在2013年，患者百分比没有差异

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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