蛋白质组学视角下的曲霉病与体液性肺泡免疫
该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦烟曲霉感染相关的呼吸系统疾病,涉及侵袭性肺曲霉病与慢性肺曲霉病,后者在全球影响约300万患者,常继发于结核及其后遗症等基础肺部病变

基本信息
资源简介
蛋白质组学视角下的曲霉病与体液性肺泡免疫
该数据集英文名为 Aspergillosis and Humoral Alveolar Immunity by Proteomics,来源于 clinicaltrials.gov,主题标签为 Aspergillus Fumigatus Infection,本站分类归入呼吸系统疾病 / 肺结核方向。数据集聚焦烟曲霉感染相关的呼吸系统疾病,涉及侵袭性肺曲霉病与慢性肺曲霉病两类主要形式。烟曲霉是人体肺部真菌感染中最常见的条件致病霉菌,在免疫功能低下患者中可导致预后较差的侵袭性肺曲霉病;慢性肺曲霉病在全球影响约300万患者,常继发于结核及其后遗症等基础肺部病变。该数据集围绕烟曲霉感染与体液性肺泡免疫的蛋白质组学研究展开,关注真菌孢子与固有免疫系统相互作用这一感染起始环节,并涉及固有免疫中细胞免疫与体液免疫的区分,其中由可溶性介质构成的体液免疫部分尚待深入描述。
【数据集背景】
烟曲霉是人体肺部真菌感染中最常见的条件致病霉菌。由烟曲霉引起的感染主要包括两类:一是在免疫功能低下患者中发生的侵袭性肺曲霉病,其预后较差;二是慢性肺曲霉病,全球约有300万患者受累,且常存在结核及其后遗症等基础肺部病变。目前用于对抗这些不同形式曲霉病的药物手段有限,且效果并不十分理想。与此同时,耐药性的出现使得寻找新的治疗策略变得尤为重要。烟曲霉孢子与人体固有免疫系统之间的相互作用是导致感染的第一步。固有免疫系统由细胞免疫和体液免疫组成,其中细胞免疫已有较为充分的描述,而由可溶性介质构成的体液免疫部分则尚待阐明。该数据集正是在这一背景下,以蛋白质组学为切入点,研究烟曲霉感染相关的体液性肺泡免疫。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Aspergillus Fumigatus Infection,本站分类为呼吸系统疾病 / 肺结核。数据集英文名称为 Aspergillosis and Humoral Alveolar Immunity by Proteomics,表明其内容围绕曲霉病与体液性肺泡免疫的蛋白质组学研究。源站描述中提及的条件为 Aspergillus Fumigatus Infection,即烟曲霉感染。数据集涉及侵袭性肺曲霉病与慢性肺曲霉病,并关注固有免疫系统中的体液免疫部分,即由可溶性介质构成的免疫组分。关于数据集的具体样本数量、变量字段、蛋白质组学检测指标、时间跨度、随访信息等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述中给出的条件为 Aspergillus Fumigatus Infection,并围绕烟曲霉感染的临床与免疫学背景进行了说明。关于具体的采集地点、采集时间、纳入与排除标准、样本类型、采集流程、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集适用于与烟曲霉感染相关的呼吸系统疾病研究,尤其是侵袭性肺曲霉病和慢性肺曲霉病方向。其主题涉及烟曲霉孢子与固有免疫系统的相互作用,以及固有免疫中体液免疫部分的研究,因此可用于探讨体液性肺泡免疫在曲霉感染中的作用。由于慢性肺曲霉病常继发于结核及其后遗症等基础肺部病变,该数据集也可能与肺结核相关研究场景存在关联。此外,鉴于现有药物手段有限且耐药性出现,该数据集可服务于寻找新的治疗策略这一研究方向。关于具体的使用场景、分析方法和研究设计,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、访问权限、文件格式、分析工具、处理流程等均未说明。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息,包括数据完整性、准确性、偏倚控制、样本量、缺失值处理等均未说明。同时,源站描述中关于体液免疫部分的表述在提供的信息中未完整呈现,可能影响对该数据集研究范围的完整理解。关于数据集的局限性,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息,包括许可协议、使用条款、引用格式、数据共享政策等均未说明。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04728763
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
疾病:烟曲霉感染。烟曲霉是人类肺部真菌感染中最常见的条件致病性霉菌。曲霉可引起侵袭性肺曲霉病,在免疫功能低下患者中预后不良,还可引起慢性肺曲霉病,全球有300万患者受其影响,这些患者通常存在基础肺部病变,如结核病及其后遗症。针对这些不同形式的感染,药物治疗手段有限且效果不佳。此外,耐药性的出现使得寻找新的治疗策略变得至关重要。真菌孢子与宿主固有免疫系统之间的相互作用是导致感染的第一步。固有免疫系统由细胞免疫和体液免疫组成。前者已有较为充分的描述,而后者由可溶性介质组成,对抗曲霉免疫至关重要,但研究相对较少。研究肺泡液中直接与曲霉孢子相互作用的可溶性介质,将有助于分析感染的早期阶段。
对未感染患者、患有各种形式曲霉病患者以及患有其他类型感染患者的支气管肺泡灌洗液中蛋白质组的分析,将有可能突出抗曲霉免疫的基本和特异性组分。本研究的目的是分析在无或有曲霉或非真菌感染情况下肺泡中天然免疫的蛋白质谱,以突出曲霉病更为特异性免疫的可溶性介质。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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