东非结核高流行区HIV阳性人群染色体5q31.1位点与结核菌素皮肤试验反应性的关联
源站描述了一项针对东非结核高流行区HIV阳性个体的全基因组关联研究，利用坦桑尼亚和乌干达前瞻性结核研究队列的469名HIV阳性患者，以结核菌素皮肤试验阳性为表型，识别与HIV感染背景下MTB感染相关的遗传位点
基本信息
资源简介
东非结核高流行区HIV阳性人群染色体5q31.1位点与结核菌素皮肤试验反应性的关联
A chromosome 5q31.1 locus associates with tuberculin skin test reactivity in HIV-positive individuals from tuberculosis hyper-endemic regions in east Africa
该数据集来自search.dataone.org，属于呼吸系统疾病/肺结核分类，主题涉及Homo Sapiens、Tuberculosis、TB infection resistance和Co-infection。源站描述了一项针对东非结核高流行区HIV阳性个体的全基因组关联研究，利用坦桑尼亚和乌干达前瞻性结核研究队列的469名HIV阳性患者，以结核菌素皮肤试验阳性为表型，识别与HIV感染背景下MTB感染相关的遗传位点。数据可用于探索结核病遗传易感性及HIV合并感染相关研究（来源 DataONE，CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：三分之一的人已感染结核分枝杆菌（MTB），而HIV感染者感染MTB的风险更高。我们假设，生活在结核病流行地区但未感染结核分枝杆菌的HIV阳性个体具有遗传抗性。采用在我们先前工作中被证明成功的“自然实验”设计，我们对469名来自坦桑尼亚和乌干达前瞻性结核研究队列的HIV阳性患者进行了结核菌素皮肤试验阳性的全基因组关联研究，以识别HIV感染背景下与MTB感染相关的遗传位点。在这些个体中，244人在入组时或超过8年的随访期间结核菌素皮肤试验（TST）呈阳性，而225人未呈阳性。我们鉴定出一个全基因组显著关联，位于显性
【主题与分类】
主题标签：Homo Sapiens、Tuberculosis、TB infection resistance、Co-infection。本站分类：呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3Afabdeefb98baa2771cafe393553fb96896cc010f2a0540d4809229f31c2cb806
使用许可：CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
三分之一的人感染过结核分枝杆菌（MTB），而HIV感染者感染MTB的风险更高。我们假设，生活在结核病流行地区但未感染结核分枝杆菌的HIV阳性个体具有遗传抗性。采用在我们先前研究中被证明成功的“自然实验”设计，我们对来自坦桑尼亚和乌干达结核病前瞻性研究队列的469名HIV阳性患者进行了结核菌素皮肤试验阳性的全基因组关联研究，以识别在HIV感染背景下与MTB感染相关的遗传位点。在这些个体中，244人在入组时或超过8年的随访期间结核菌素皮肤试验（TST）呈阳性，而225人呈阴性。我们在合并队列中发现了rs877356的显性模型与二元TST状态之间的全基因组显著关联（OR=0.2671，p=1.22x10-8）。关联…
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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