数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Af3155751efff346df7faa6c2d8667bb9dfaa4184ee24332daea48538bb3d8606

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症是一种免疫悖论：宿主防御对生存至关重要，但同时也参与器官损伤和死亡。利用肺活体显微镜技术，我们定义了微循环中中性粒细胞和血小板对大肠杆菌脓毒症应答的免疫血栓形成级联反应。中性粒细胞cathelicidin通过甲酰肽受体将中性粒细胞定位至大肠杆菌，并启动初始免疫血栓。免疫血栓捕获血管内细菌，cathelicidin使血小板具备抗菌活性。阻断cathelicidin可阻止免疫血栓形成级联反应并减轻早期脓毒症死亡，但会导致感染失控和延迟死亡。LTB4可放大免疫血栓，抑制LTB4可减少有害免疫血栓同时保留宿主防御，因此代表了脓毒症疾病进展的一个离散拐点。因此，靶向免疫血栓级联反应可在脓毒症期间减轻免疫病理损伤而不抑制宿主防御。

小鼠脓毒症期间肺中性粒细胞-血小板免疫血栓形成级联反应的可视化

数据集 DOI：10.5061/dryad.0k6djhbfz

数据及文件结构说明

使用 Imaris 软件（Oxford Instruments，v10.1）对中性粒细胞行为进行表征。简言之，对相应通道应用表面重建并采用绝对强度阈值。中性粒细胞过滤掉体素 <40 的部分，血小板和内皮则过滤掉 <10 的部分。使用斑点（Spots）功能追踪细菌。测量中性粒细胞的细胞特征，包括面积、球形度（极化）、血小板表面重叠、与大肠杆菌的距离等。采用二维视频成像对肺微血管系统中的细胞行为进行分析。将中性粒细胞的 Imaris 表面和追踪参数连同特定原始值导出至 Microsoft Excel。将所关注的形态学和运动学参数的提取原始值导出为 .csv 文件并加载至……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。