ATCC46645菌株与同源M-NM-^TpacC烟曲霉突变体小鼠感染转录谱

该数据集来自omicsdi.org,主题为转录组学,分类属呼吸系统疾病/其他。数据为ATCC46645菌株与同源M-NM-^TpacC烟曲霉突变体在小鼠感染过程中的时序转录谱,包含ch1处理方案

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时间序列分类Transcriptomics
Transcriptional profiling of ATCC46645 strain and isogenic M-NM-^TpacC Aspergillus fumigatus mutant during murine infection

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

ATCC46645菌株与同源M-NM-^TpacC烟曲霉突变体小鼠感染转录谱

该数据集来自omicsdi.org,主题为转录组学,分类属呼吸系统疾病/其他。数据为ATCC46645菌株与同源M-NM-^TpacC烟曲霉突变体在小鼠感染过程中的时序转录谱,包含ch1处理方案。源站描述指出,烟曲霉pH响应转录因子PacC调控侵袭性肺部感染中分泌蛋白酶的表达,为上皮侵袭和致病性所必需,且M-NM-^TpacC突变体在感染中异常重塑真菌细胞壁。该数据可用于研究PacC介导的宿主损伤机制及肺曲霉病相关基因表达分析(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在由主要霉菌病原体烟曲霉引起的肺部疾病中,肺上皮被真菌菌丝的侵袭性生长所破坏,这一过程被认为需要真菌蛋白酶。本研究表明,烟曲霉pH响应转录因子PacC在侵袭性肺部感染期间调控分泌蛋白酶的表达,并且是上皮侵袭和致病性所必需的。此外,烟曲霉M-NM-^TpacC突变体在感染期间异常重塑真菌细胞壁。本研究定义了肺曲霉病期间PacC介导的宿主损伤的不同机制。ch1:处理方案 小鼠感染期间ATCC46645菌株与同源M-NM-^TpacC烟曲霉突变体的时序转录谱分析

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-54810

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在由主要霉菌病原体烟曲霉引起的肺部疾病中,肺上皮被真菌菌丝的侵袭性生长所破坏,这一过程被认为需要真菌蛋白酶。本研究表明,烟曲霉pH响应性转录因子PacC在侵袭性肺部感染期间调控分泌型蛋白酶的表达,并且是上皮侵袭和致病性所必需的。此外,烟曲霉ΔpacC突变体在感染过程中异常重塑真菌细胞壁。本研究明确了肺曲霉病期间PacC介导的宿主损伤的不同机制。ch1:治疗方案 小鼠感染期间ATCC46645菌株及同基因ΔpacC烟曲霉突变体的时间转录谱分析

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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