MCF7乳腺癌细胞与正常乳腺组织来源样本的mRNA RNA-seq

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-1961

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为加深对正常与肿瘤乳腺细胞间差异甲基化影响基因表达的理解，我们进行了RNA测序，以评估正常乳腺组织和MCF7乳腺癌细胞系中的mRNA表达变化。我们在MCF7细胞中鉴定出6632个显著差异表达的蛋白编码基因（FDR阈值为0.05）。IPA Bio-Function富集分析显示，“细胞死亡与存活”和“细胞生长与增殖”是与差异表达基因相关的前2个条目。对The Cancer Genome Atlas (TCGA)乳腺数据的癌症与正常样本分析显示，在MCF7中差异上调和下调的基因在临床标本中大多分别呈过表达和低表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。