健康人与慢性阻塞性肺疾病患者痰液、尿液和粪便微生物组
该数据集来源于 clinicaltrials.gov,聚焦健康人与慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的微生物组,涵盖痰液、尿液和粪便等多种样本

基本信息
资源简介
健康人与慢性阻塞性肺疾病患者痰液、尿液和粪便微生物组
该数据集英文名为 The Microbiome of Sputum, Urine and Feces in Healthy Persons and Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Patients,来源于 clinicaltrials.gov,聚焦健康人与慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的微生物组,涵盖痰液、尿液和粪便等多种样本。数据集围绕肺部疾病、慢性阻塞性肺疾病、肺气肿或 COPD 以及微生物群等主题,属于呼吸系统疾病分类下的“其他”类别。其核心研究思路是在“肠-肺轴”理论提出后,通过横断面研究分析多种样本中微生物组的组成,并比较 COPD 患者与健康吸烟者之间的差异,以期为人体的肠-肺轴模型建立提供帮助。
【数据集背景】
在“肠-肺轴”理论提出之后,大量研究揭示了健康吸烟者与 COPD 患者之间,来自呼吸道样本或肺组织的微生物组存在多样性。此前的研究已报告,健康吸烟者与 COPD 患者的肺组织微生物组组成存在明显差异。该数据集所对应的研究正是在这一背景下展开的横断面研究,旨在分析多种样本(如粪便、痰液和尿液)中微生物组的组成,并比较 COPD 患者与健康吸烟者之间组成的差异。该研究有助于在人体中建立肠-肺轴模型。
【数据内容】
数据集的主题标签包括 Pulmonary Disease, Chronic Obstructive、Emphysema or COPD 以及 Microbiota。所涉及的样本类型包括痰液、尿液和粪便,研究对象为健康人与慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者。源站描述中提及的疾病条件包括肺部疾病、慢性阻塞性肺疾病、肺气肿或 COPD,以及微生物群。关于样本的具体数量、受试者人数、测序方法、微生物组指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述表明这是一项横断面研究,用于分析多种样本(例如粪便、痰液和尿液)中微生物组的组成,并比较 COPD 患者与健康吸烟者之间的组成差异。关于采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性阻塞性肺疾病(COPD)及微生物组相关的研究场景,例如比较 COPD 患者与健康吸烟者在痰液、尿液和粪便等样本中微生物组组成的差异,探讨“肠-肺轴”在人体中的表现,以及为建立人体肠-肺轴模型提供数据支持。关于具体的分析模型、统计方法或临床应用场景,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据访问方式、文件格式、字段结构、分析流程等均未在源站描述中体现。
【质量与限制】
该数据集为横断面研究,其设计用于分析特定时间点上微生物组组成的差异,不涉及纵向随访信息。关于样本量、数据完整性、测序深度、质量控制措施以及潜在偏倚等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合源站描述所限定的研究范围理解其结论的适用范围。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03755505
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:肺部疾病、慢性阻塞性肺疾病、肺气肿或COPD、微生物群。在肠-肺轴理论提出后,大量研究揭示了健康吸烟者与COPD患者呼吸道样本或肺组织中微生物组的多样性。既往研究报告了健康吸烟者与COPD患者肺组织微生物群组成的显著差异。这是一项横断面研究,旨在分析多种样本(如粪便、痰液和尿液)的微生物群组成,并比较COPD患者与健康吸烟者之间的组成差异。本研究将有助于在人体中建立肠-肺轴模型。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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