重度慢性阻塞性肺疾病患者表型识别(Groningen重度COPD队列)

该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦重度慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者,旨在基于临床、基因组及表观基因组因素识别COPD表型亚组

University Medical Center GroningenUniversity Medical Center Groningen
clinicaltrials
浏览 11
医学影像分类Severe COPD
The Identification of Phenotypes in Patients With Severe Chronic Obstructive Pulmonary Disease (Groningen Severe COPD Cohort)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

重度慢性阻塞性肺疾病患者表型识别(Groningen重度COPD队列)

该数据集英文名为 The Identification of Phenotypes in Patients With Severe Chronic Obstructive Pulmonary Disease(Groningen Severe COPD Cohort),来源于 clinicaltrials.gov,主题聚焦重度慢性阻塞性肺疾病(Severe COPD)。慢性阻塞性肺疾病以气道阻塞为特征,但气流受限程度并不能充分描述该病的复杂性,因为患者之间在临床表现、生理、影像、治疗反应、肺功能下降和生存方面存在显著异质性。该数据集旨在基于临床或基因组、表观基因组因素识别重度 COPD 患者的表型亚组,为更早识别和描述该疾病提供依据。本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。

【数据集背景】

慢性阻塞性肺疾病(COPD)以气道阻塞为定义特征,但气流受限的程度不足以充分刻画该病的复杂性。患者之间在临床表现、生理、影像、对治疗的反应、肺功能下降以及生存等方面均存在显著异质性。目前尚不存在描述 COPD 的明确替代方案,而基于临床或基因组与表观基因组因素识别 COPD 患者的亚组(即表型)可能具有实用价值。非常重度 COPD 患者持续流向 UMCG,为研究者开展关于极重度 COPD 表型及其背后基因—环境相互作用的研究提供了独特机会。研究者预期该研究的发现将有助于更早地识别相关表型。

【数据内容】

该数据集聚焦重度慢性阻塞性肺疾病患者,核心内容围绕患者表型的识别展开,涉及临床、基因组及表观基因组因素等层面的信息,用于划分 COPD 患者的表型亚组。源站描述中提及的研究关注极重度 COPD 表型及 underlying gene-environment interaction(基因—环境相互作用)。关于具体变量字段、样本量、随访时长、检测指标种类等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 clinicaltrials.gov。源站描述指出,非常重度 COPD 患者持续流向 UMCG,使研究者得以开展针对极重度 COPD 表型及基因—环境相互作用的研究。关于采集地点、采集时间窗、纳入与排除标准、采样流程等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于重度 COPD 表型识别相关的研究场景,包括基于临床因素或基因组、表观基因组因素划分患者亚组,探索患者异质性的生物学基础,以及研究基因—环境相互作用在极重度 COPD 中的表现。其潜在应用方向包括支持更早识别相关表型。关于具体分析任务类型或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04023409

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:重度COPD。理由:慢性阻塞性肺疾病(COPD)以气道阻塞为特征。然而,气流受限的程度并不能充分描述COPD的复杂性,因为患者之间在临床表现、生理学、影像学、治疗反应、肺功能下降和生存方面存在显著异质性。目前,尚无明确的替代方法来描述COPD,但基于临床或基因组及表观基因组因素(表型)识别COPD患者亚组可能是有用的。极重度COPD患者持续转诊至UMCG,为研究者提供了独特机会,得以开展关于极重度COPD表型及其潜在基因-环境相互作用的研究。研究者预期,本研究结果将有助于更早识别那些有发生重度或极重度COPD风险的对象。此外,这将有助于对已确诊COPD进行更好的临床特征描述,可能使不同COPD亚表型能够获得更有针对性的治疗。

目标:主要目标:通过聚类分析识别重度慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的新临床表型。次要目标:* 识别重度COPD患者的临床表型(基于肺功能、临床、影像学、全身性、病理学和免疫学参数等)。* 识别重度COPD患者的内型/中间表型。* 探讨(表观)基因组学(包括遗传学和基因表达)在表征重度COPD患者亚群中的贡献。研究设计:采用两阶段设计的观察性横断面研究。研究人群:因肺移植或支气管镜肺减容咨询转诊至UMCG的重度COPD患者。主要研究参数:主要研究参数是识别新的临床

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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