重度慢性阻塞性肺疾病患者表型识别(Groningen重度COPD队列)
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦重度慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者,旨在基于临床、基因组及表观基因组因素识别COPD表型亚组

基本信息
资源简介
重度慢性阻塞性肺疾病患者表型识别(Groningen重度COPD队列)
该数据集英文名为 The Identification of Phenotypes in Patients With Severe Chronic Obstructive Pulmonary Disease(Groningen Severe COPD Cohort),来源于 clinicaltrials.gov,主题聚焦重度慢性阻塞性肺疾病(Severe COPD)。慢性阻塞性肺疾病以气道阻塞为特征,但气流受限程度并不能充分描述该病的复杂性,因为患者之间在临床表现、生理、影像、治疗反应、肺功能下降和生存方面存在显著异质性。该数据集旨在基于临床或基因组、表观基因组因素识别重度 COPD 患者的表型亚组,为更早识别和描述该疾病提供依据。本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。
【数据集背景】
慢性阻塞性肺疾病(COPD)以气道阻塞为定义特征,但气流受限的程度不足以充分刻画该病的复杂性。患者之间在临床表现、生理、影像、对治疗的反应、肺功能下降以及生存等方面均存在显著异质性。目前尚不存在描述 COPD 的明确替代方案,而基于临床或基因组与表观基因组因素识别 COPD 患者的亚组(即表型)可能具有实用价值。非常重度 COPD 患者持续流向 UMCG,为研究者开展关于极重度 COPD 表型及其背后基因—环境相互作用的研究提供了独特机会。研究者预期该研究的发现将有助于更早地识别相关表型。
【数据内容】
该数据集聚焦重度慢性阻塞性肺疾病患者,核心内容围绕患者表型的识别展开,涉及临床、基因组及表观基因组因素等层面的信息,用于划分 COPD 患者的表型亚组。源站描述中提及的研究关注极重度 COPD 表型及 underlying gene-environment interaction(基因—环境相互作用)。关于具体变量字段、样本量、随访时长、检测指标种类等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 clinicaltrials.gov。源站描述指出,非常重度 COPD 患者持续流向 UMCG,使研究者得以开展针对极重度 COPD 表型及基因—环境相互作用的研究。关于采集地点、采集时间窗、纳入与排除标准、采样流程等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于重度 COPD 表型识别相关的研究场景,包括基于临床因素或基因组、表观基因组因素划分患者亚组,探索患者异质性的生物学基础,以及研究基因—环境相互作用在极重度 COPD 中的表现。其潜在应用方向包括支持更早识别相关表型。关于具体分析任务类型或已验证的应用案例,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04023409
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:重度COPD。理由:慢性阻塞性肺疾病(COPD)以气道阻塞为特征。然而,气流受限的程度并不能充分描述COPD的复杂性,因为患者之间在临床表现、生理学、影像学、治疗反应、肺功能下降和生存方面存在显著异质性。目前,尚无明确的替代方法来描述COPD,但基于临床或基因组及表观基因组因素(表型)识别COPD患者亚组可能是有用的。极重度COPD患者持续转诊至UMCG,为研究者提供了独特机会,得以开展关于极重度COPD表型及其潜在基因-环境相互作用的研究。研究者预期,本研究结果将有助于更早识别那些有发生重度或极重度COPD风险的对象。此外,这将有助于对已确诊COPD进行更好的临床特征描述,可能使不同COPD亚表型能够获得更有针对性的治疗。
目标:主要目标:通过聚类分析识别重度慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的新临床表型。次要目标:* 识别重度COPD患者的临床表型(基于肺功能、临床、影像学、全身性、病理学和免疫学参数等)。* 识别重度COPD患者的内型/中间表型。* 探讨(表观)基因组学(包括遗传学和基因表达)在表征重度COPD患者亚群中的贡献。研究设计:采用两阶段设计的观察性横断面研究。研究人群:因肺移植或支气管镜肺减容咨询转诊至UMCG的重度COPD患者。主要研究参数:主要研究参数是识别新的临床
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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