上皮分泌组细胞类型差异的系统分析揭示RSV诱导下呼吸道感染发病机制

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080867

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数据说明

人类呼吸道合胞病毒（RSV）引起的下呼吸道感染（LRTI）是儿童发病的重要原因。LRTI发病机制的一部分源于受感染的下气道细胞产生的信号，这些信号改变淋巴细胞群体并触发气道重塑。为了深入了解这一过程，我们对代表气管（hBECs）与小气道细支气管细胞（hSAECs）的细胞中RSV诱导的上皮分泌反应进行了无偏定量蛋白质组学分析。最初使用端粒酶永生化人上皮细胞标准化了工作流程，该流程在分泌蛋白和分离的纳米颗粒（外泌体）的蛋白质组学特征中显示出高重现性和细胞类型差异。超过一半的分泌组蛋白包含在外泌体中，其余来源于溶酶体和空泡区室。我们将此工作流程应用于三个独立衍生的人原代培养物。在1%错误发现率（FDR）下，从对照上清液中鉴定出577个差异表达蛋白，从RSV感染细胞上清液中鉴定出966个差异表达蛋白。

15种蛋白质是RSV感染的hBECs所特有的，受上皮特异性ets同源因子（EHF）调控。106种蛋白质是RSV感染的hSAECs所特有的，富含受NF-κB转录因子调控的蛋白质。在后一组中，我们独立验证了趋化因子（C-C基序）配体20（CCL20）/巨噬细胞诱导蛋白（MIP）3α、胸腺基质淋巴细胞生成素（TSLP）和趋化因子（CC）配体3样1（CCL3-L1）的差异表达。CCL20/MIP3α是RSV感染的hSAEC分泌组中最活跃的黏蛋白诱导因子，并且在RSV感染小鼠模型的小气道中差异表达。这些研究有助于深入了解外泌体产生在先天反应中的作用，以及参与RSV LRTI诱导的发病机制的上皮分泌组的区域差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。