慢性阻塞性肺疾病人肺组织的空间转录组图谱（Xenium）
该数据集为慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织的空间转录组图谱，基于 Xenium 平台。数据来源于 omicsdi.org，主题标签为 Genomics，本站归类于呼吸系统疾病 / 其他
![Spatial transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) [Xenium]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/119519.jpg)
基本信息
资源简介
慢性阻塞性肺疾病人肺组织的空间转录组图谱（Xenium）
该数据集为慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织的空间转录组图谱，基于 Xenium 平台完成。其英文名称为 Spatial transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) [Xenium]，主题标签为 Genomics，在来源站 omicsdi.org 上登记，本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。该数据集的核心价值在于将空间转录组技术应用于人类肺部组织，从而在保留组织空间位置信息的前提下，观察慢性阻塞性肺疾病相关组织中基因表达的空间分布特征。对于呼吸系统疾病研究领域而言，此类数据有助于从组织原位层面理解疾病状态下的转录活动，弥补传统批量转录组或单细胞转录组在空间信息上的不足。
【数据集背景】
慢性阻塞性肺疾病是一种以持续气流受限为特征的常见呼吸系统疾病，其发生发展涉及肺组织多种细胞类型和微环境的改变。传统转录组研究通常将组织打碎后测序，丢失了细胞在组织中的原始位置信息；而空间转录组技术能够在保留组织切片空间坐标的同时检测基因表达，为研究疾病相关区域、细胞邻域和微环境提供了新的手段。该数据集正是围绕人肺组织、以 COPD 为背景、采用 Xenium 平台生成的空间转录组数据，主题标签为 Genomics，本站分类为呼吸系统疾病 / 其他。关于该数据集的具体研究动机、样本分组和实验设计细节，源站未提供。
【数据内容】
根据来源站描述，该数据集的内容为“Spatial transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) [Xenium]”，即慢性阻塞性肺疾病人肺组织的空间转录组图谱，基于 Xenium 平台。其主题标签为 Genomics。除上述信息外，关于数据所包含的基因数量、细胞数量、组织切片数量、空间分辨率、表达矩阵格式、图像文件类型等具体内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，来源站对其的描述与数据集英文名称一致，即 Spatial transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) [Xenium]。主题标签为 Genomics，本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。关于样本采集地点、供体信息、伦理审批、实验流程、测序深度、平台参数等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是慢性阻塞性肺疾病相关的空间转录组研究场景。由于主题标签为 Genomics，且基于 Xenium 平台，潜在用途包括在组织原位水平探索基因表达的空间分布、识别疾病相关区域或细胞邻域、与单细胞转录组或其他空间转录组数据进行比较分析等。本站分类为呼吸系统疾病 / 其他，也提示其可服务于呼吸系统疾病领域的探索性分析。关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否经过特定验证或是否支持特定疾病亚型比较，源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 omicsdi.org，可通过来源站获取其登记信息。关于具体的数据下载方式、文件组织格式、所需分析软件、预处理步骤、标准化流程以及配套代码或可视化工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 Xenium 平台，主题标签为 Genomics，来源站描述与其英文名称一致。关于数据质量指标、批次效应、样本量、覆盖度、重复性、验证情况以及使用时的技术或生物学限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org。关于其引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1378106
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Spatial transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) [Xenium]
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
