COVID-19疾病严重程度相关的SnoRNAs与miRNAs表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10970

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

致病微生物严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）在感染患者中表现出广泛的临床表现。COVID-19的严重程度差异很大，从无症状感染和轻症病例到重症病例，重症可导致急性呼吸窘迫综合征（ARDS）和多器官衰竭，生存率低。miRNA能够通过结合靶mRNA的3′UTR诱导其降解，从而调控包括增殖、凋亡和分化在内的多种细胞过程，因此在转录后抑制中发挥基础性作用。已有研究报道，包括SARS相关冠状病毒在内的多种炎症性和感染性疾病中，血液miRNA水平会发生改变。我们使用微阵列技术描绘了重症COVID-19病例（n=9）外周血中的miRNA和snoRNA特征，并与轻症（n=10）和无症状（n=10）患者进行比较，鉴定出重症与无症状之间以及重症与轻症COVID-19病例之间差异表达的转录本。研究选取了29例年龄匹配的男性患者队列。

所有患者此前均使用TaqPath COVID-19 Combo Kit（Thermo Fisher Scientific，马萨诸塞州沃尔瑟姆）或Cobas SARS-CoV-2 Test（Roche Diagnostics，瑞士罗特克鲁兹）确诊COVID-19，CT值<30。选择的附加标准为年龄在35至75岁之间。参与者被分为重症、轻症和无症状组。重症病例的分类依据是需要高流量氧支持和入住ICU（n=9）。而轻症患者则根据症状和影像学阳性发现并伴有肺部受累来识别（n=10）。无临床表现的患者被标记为无症状病例（n=10）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。