急性COVID-19及恢复期先天性与适应性免疫应答综合分析送样采集

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04582903

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：COVID-19感染。研究描述：这是一项前瞻性样本采集方案，旨在接收寄送的生物样本（例如血液、唾液、粪便、尿液以及临床采集的剩余样本），用于探索性研究，以表征对2019冠状病毒病（COVID-19）或其他新发或再发呼吸道病毒的免疫反应。参与者不会在NIH进行访视。根据本方案，将纵向采集确诊或疑似严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染或其他新发或再发呼吸道病毒患者的样本，并送至NIH进行研究评估。此外，还将从未感染患者及患者亲属中采集样本。将进行检测以增进对这些病毒宿主免疫反应的理解，包括但不限于遗传学、分子和蛋白质组学检测。与参与者健康和医疗护理相关的发现可能会返还给他们及其转诊医疗保健提供者或研究团队。

目标：主要目标：实现对感染SARS-CoV-2或其他新发或再发呼吸道病毒期间及之后宿主免疫反应的遗传学、免疫学、分子学和病毒学特征描述，这些特征将与临床病程和结果数据相关联。终点：主要终点：1. 鉴定与SARS-CoV-2或其他新发或再发呼吸道病毒引起的严重/致死性疾病或感染抵抗性相关的遗传变异。2. 描述感染SARS-CoV-2或其他新发或再发呼吸道病毒后急性期及恢复期固有免疫和适应性免疫反应的动态变化特征。3. 测定感染SARS-CoV-2或其他新发或再发呼吸道病毒后急性期及恢复期产生的促炎/抗炎细胞因子，包括干扰素（IFN）特征性反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。