猪繁殖与呼吸综合征病毒感染期间后备母猪血液基因表达RNA测序分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-75304

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染妊娠母猪会导致胎儿死亡和仔猪死亡率升高，但不同母体之间生殖病理的程度存在显著差异。本研究利用RNA测序技术，对妊娠后备母猪在感染后第一周内全血转录组对PRRSV的应答进行了表征，并尝试鉴定在接种后21天剖检时与低或高胎儿死亡率相关的基因表达特征。RNA测序实验比较了两组后备母猪的全血基因表达：低胎儿死亡率组（LFM）和高胎儿死亡率组（HFM）（每组n=8）。共进行了两组对比分析。第一，时间进程实验，将接种后第2天（D2）的基因表达与第0天（D0——即接种前）进行比较，并将接种后第6天的表达与D2进行比较。第二，在三个时间点（D0、D2和D6）分别比较LFM组与HFM组之间的基因表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。