急诊急性结肠炎与感染性腹泻的FilmArray®胃肠道Panel及血清降钙素原结果
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦急诊科就诊的急性腹泻与疑似感染性急性结肠炎患者。研究描述血清降钙素原(PCT)浓度,并依据粪便多重胃肠道PCR panel(GI panel)和粪便培养所识别的病毒或细菌病因,评估PCT作为细菌感染生物标志物的效用

基本信息
资源简介
急诊急性结肠炎与感染性腹泻的FilmArray®胃肠道Panel及血清降钙素原结果
该数据集来自 clinicaltrials.gov,英文名称为 Results of FilmArray® Gastro-intestinal Panel and Serum Procalcitonin in Acute Colitis and Infectious Diarrhea in the ER,聚焦急诊科就诊的急性腹泻与疑似感染性急性结肠炎患者。研究描述这一人群的血清降钙素原(PCT)浓度,并依据粪便多重胃肠道 PCR panel(GI panel)和粪便培养所识别的病毒或细菌病因,评估 PCT 作为细菌感染生物标志物的效用。数据集主题标签为急性腹泻与疑似感染性急性结肠炎,在本站归入呼吸系统疾病 / 其他分类。
【数据集背景】
急性腹泻和感染性急性结肠炎是急诊科常见的就诊原因。目前的病因诊断路径局限于炎症标志物测定,如 C 反应蛋白(CRP)和血液白细胞,这些指标对细菌感染缺乏特异性和敏感性。粪便培养虽可检出粪便中的细菌病原体,但结果至少需 48 小时才能获得,且阳性率低于 50%。在此背景下,该研究关注降钙素原(PCT)这一细菌感染生物标志物在该人群中的表现,试图通过描述其浓度分布,结合粪便多重胃肠道 PCR panel 与粪便培养所识别的病毒或细菌病因,评估其临床效用。研究者的假设是:若 GI panel 或粪便培养提示细菌病因,PCT 水平会更高。
【数据内容】
数据集围绕急诊科急性腹泻与疑似感染性急性结肠炎患者展开,核心内容为血清降钙素原(PCT)浓度的描述性数据,以及与病因学检测结果的关联分析。病因学检测包括粪便多重胃肠道 PCR panel(GI panel)和粪便培养,用于区分病毒或细菌病因。数据集主题标签为急性腹泻、疑似感染性急性结肠炎。源站描述未提及具体样本量、PCT 数值范围、检测时间点或统计分析方法等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 clinicaltrials.gov 登记的研究。研究对象为急诊科就诊的急性腹泻和疑似感染性急性结肠炎患者。采集内容涉及血清 PCT 浓度测定,以及粪便多重胃肠道 PCR panel 和粪便培养的病原学结果。源站描述未提供具体的采集机构、采集时间窗、样本处理流程或数据录入方式,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于急诊科急性腹泻与感染性急性结肠炎的病因诊断研究场景,尤其是评估 PCT 作为细菌感染生物标志物的效用。可用于比较不同病因(病毒 vs 细菌)下 PCT 浓度的差异,辅助判断 PCT 在细菌感染识别中的潜在价值,也可为急诊科炎症标志物与病原学检测联合应用的研究提供参考。源站描述未提及其他具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
使用时应以血清 PCT 浓度为核心变量,结合粪便多重胃肠道 PCR panel 和粪便培养所识别的病毒或细菌病因进行分组分析,观察不同病因组间 PCT 水平的差异,以检验研究者关于细菌病因组 PCT 水平更高的假设。源站描述未提供具体的数据格式、变量编码、统计软件或分析脚本,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述指出,现有炎症标志物 CRP 和血液白细胞对细菌感染缺乏特异性和敏感性,粪便培养结果延迟至少 48 小时且阳性率低于 50%,这些均是本研究试图弥补的诊断局限。数据集本身的样本量、数据完整性、缺失值处理及偏倚控制等信息,源站未提供。使用时应注意到源站描述未给出 PCT 测定的具体方法学细节和结果数据,源站未提供。
【引用与许可】
数据集英文名称为 Results of FilmArray® Gastro-intestinal Panel and Serum Procalcitonin in Acute Colitis and Infectious Diarrhea in the ER,来源站为 clinicaltrials.gov。源站描述未提供具体的引用格式、许可条款或数据使用限制,源站未提供。
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04237181
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
研究条件:急性腹泻、推测为感染性起源的急性结肠炎。急性腹泻和感染性急性结肠炎是急诊科就诊的常见原因。目前的病因学诊断方法仅限于测定炎症标志物,如C反应蛋白(CRP)和血液白细胞,但这些指标对细菌感染缺乏特异性和敏感性。粪便培养可检测粪便中的细菌病原体,但结果至少需48小时才能获得,且阳性率<50%。本研究将描述该人群中降钙素原(PCT)浓度(一种细菌感染生物标志物),以评估其根据粪便多重胃肠道PCR检测组合(GI panel)和粪便培养所确定的病毒或细菌病因的实用性。研究者假设,如果GI panel或粪便培养鉴定出细菌或寄生虫,PCT水平将升高,正如呼吸道感染中的情况一样。如果GI panel检测到病毒,或粪便培养与GI panel均为阴性,研究者预期PCT值将较低或为阴性。
研究者将纳入因疑似感染性腹泻或急性结肠炎而就诊于急诊科的患者,以获得具有代表性的大规模感染性腹泻病因面板。仅纳入那些作为常规诊疗而开具血样采集的患者。血样可用于检测CRP和全血细胞计数(WBC),这些是当前在此背景下进行的生物学分析的一部分。在获得患者同意后,研究者将在血样采集时增加PCT检测,并要求患者提供粪便样本,以便进行粪便培养,并通过多重PCR技术(Filmarray ®GI panel)对病原体进行扩展检测。将询问医生,所有这些结果(当前开具的检测结果以及PCT检测和GI panel的结果)是否会改变其开始抗生素治疗的决定
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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