COVID-19 后呼吸道病毒宏基因组研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05126589

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：COVID-19呼吸道感染。1. 这是一项系列横断面研究。参与者将被要求在指定的采集期内，参照流感季节完成问卷并自行采集鼻腔和咽喉拭子。2. 受试者将通过邮寄方式邀请，从香港全境随机选出的家庭中招募。符合条件者为通常居住在该地址、能以书面中文或英文沟通的成年人。无法给出知情同意者将被排除。其他排除标准为：患有精神疾病者、囚犯。已获得临床研究伦理委员会批准。3. 将使用一份双语问卷，包含四个部分：(a) 社会人口学信息；(b) SARS-CoV-1感染史和疫苗接种史；© 采样前的暴露环境；(d) 采样时是否存在流感样疾病(ILI)及其类型（如有）；4.

在提供鼻腔和咽喉拭子采集套件的情况下，参与者应在流感季节开始后的3个月内，当出现流感样疾病（ILI）时采集鼻腔/咽喉样本；若未出现此类疾病，则在季节结束时采集。自采拭子需在采样后48小时内随问卷一同交回。交回拭子后，将向参与者发放50港元购物券，以补偿其时间。5. 将从采集的样本中提取RNA，随后进行宏基因组分析。所收集的数据将经过整理、核查和校对，以形成研究数据库。将进行描述性统计，包括标准频率表和指标。6. 本研究的主要结局是不同流感季节病毒丰度的变化，以及参与者样本中病毒分类群分布的差异。7. 分析完成后，呼吸道感染的传播风险可

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。