支气管肺泡灌洗液、支气管活检、血清和诱导痰中潜在COPD生物标志物的可重复性及相互关系
该数据集来自 plos.figshare.com，配套 2012 年发表于 PLoS ONE 的研究，包含 11 个文件（图片与表格补充材料）
基本信息
资源简介
支气管肺泡灌洗液、支气管活检、血清和诱导痰中潜在COPD生物标志物的可重复性及相互关系
Repeatability of and Relationship between Potential COPD Biomarkers in Bronchoalveolar Lavage, Bronchial Biopsies, Serum, and Induced Sputum
该数据集来自 plos.figshare.com，配套 2012 年发表于 PLoS ONE 的研究，包含 11 个文件（图片与表格补充材料）。研究在 23 名健康吸烟者和 24 名年龄、性别匹配的吸烟 COPD 患者（GOLD II）中，于 6 周内两次采集支气管肺泡灌洗液、支气管活检、血清和诱导痰样本，对超过 100 种标志物进行验证分析，发现 51 种标志物具有足够可重复性（组内相关系数>0.6），且各组间存在标志物差异。数据可用于 COPD 炎症表型生物标志物的可重复性评估及相关性研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Repeatability of and Relationship between Potential COPD Biomarkers in Bronchoalveolar Lavage, Bronchial Biopsies, Serum, and Induced Sputum》发表于 PLoS ONE（2012），DOI：10.1371/journal.pone.0046207。源站首次发布：2012-10-04。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种主要影响气道的慢性炎症性疾病。需要稳定的生物标志物来表征该疾病的炎症表型，这些标志物应与疾病活动度相关并适合预测疾病进展，从而用于监测药物干预的疗效和安全性。因此，我们分析了 23 名健康吸烟者和 24 名年龄和性别匹配的吸烟 COPD 患者（GOLD II）的支气管肺泡灌洗液、支气管活检、血清和诱导痰中的大量标志物。样本采集在 6 周内进行两次。在分析之前，针对相应基质对超过 100 种不同标志物的检测方法进行了验证。在我们的研究中，我们发现 51 种标志物具有足够的可重复性（组内相关系数>0.6），其中大多数在血清中。在所有 c 中观察到组间标志物差异
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个，合计 1.22 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0046207。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Immunology。主题标签：repeatability、copd、biomarkers、bronchoalveolar、bronchial、induced、sputum。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Repeatability_of_and_Relationship_between_Potential_COPD_Biomarkers_in_Bronchoalveolar_Lavage_Bronchial_Biopsies_Serum_and_Induced_Sputum/118952
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Röpcke, Stefan; Holz, Olaf; Lauer, Gereon; Müller, Meike; Rittinghausen, Susanne; Ernst, Peter; et al. (2016). Repeatability of and Relationship between Potential COPD Biomarkers in Bronchoalveolar Lavage, Bronchial Biopsies, Serum, and Induced Sputum. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Repeatability of and Relationship between Potential COPD Biomarkers in Bronchoalveolar Lavage, Bronchial Biopsies, Serum, and Induced Sputum
- DOI：10.1371/journal.pone.0046207
- 发布日期：2012-10-04
- 文件数：11 个
- 文件总体积：1.22 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Repeatability_of_and_Relationship_between_Potential_COPD_Biomarkers_in_Bronchoalveolar_Lavage_Bronchial_Biopsies_Serum_and_Induced_Sputum/118952
命令行下载
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文件清单
Figure_S1.tif（293.93 KB）Figure_S2.tif（293.94 KB）Table_S1.doc（108.03 KB）Table_S2.doc（53.76 KB）Table_S3.doc（89.60 KB）Table_S4.doc（80.38 KB）Table_S5.doc（129.54 KB）Table_S6.doc（34.82 KB）Table_S7.doc（30.72 KB）Table_S8.doc（80.90 KB）Text_S1.doc（25.60 KB）
文件总体积 1.22 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种主要累及气道的慢性炎症性疾病。为了监测药物干预的疗效和安全性，需要能够表征该疾病炎症表型、与疾病活动度相关并适合预测疾病进展的稳定生物标志物。因此，我们分析了23名健康吸烟者和24名年龄、性别匹配的吸烟COPD患者（GOLD II级）的支气管肺泡灌洗液、支气管活检组织、血清和诱导痰中的大量标志物。样本采集在6周内进行了两次。分析前，针对各自基质对100多种不同标志物的检测方法进行了验证。在本研究中，我们发现51种标志物具有足够的重复性（组内相关系数>0.6），其中大多数位于血清中。观察到各组间所有区室的标志物均存在差异，这扩展了（血管性血友病因子）并证实了（如C反应蛋白、白细胞介素-6）既往研究结果。未观察到肺与血清标志物之间的相关性，包括A1AT。由痰中性粒细胞定义的气道炎症仅显示出中等程度的重复性。
当联合使用中性粒细胞和四种痰液液相标志物来定义炎症表型时，这一情况可能得到改善。总之，我们的研究提供了关于COPD相关肺部和全身标志物的可重复性及相互关系的全面信息。这些结果对正在进行的大型临床试验和未来的COPD研究具有重要意义。虽然血清标志物能够区分患有和不患有COPD的吸烟者，但它们似乎不足以反映气道内与疾病相关的炎症过程。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0046207（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Repeatability_of_and_Relationship_between_Potential_COPD_Biomarkers_in_Bronchoalveolar_Lavage_Bronchial_Biopsies_Serum_and_Induced_Sputum/118952）。
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