早期CF肺病中的肺部急性加重
背景：在慢性囊性纤维化（CF）肺病中，中性粒细胞炎症和T细胞抑制同时发生，部分原因是中性粒细胞介导释放T细胞抑制酶Arg1
基本信息
资源简介
早期CF肺病中的肺部急性加重
该数据集名为“Pulmonary exacerbations in early CF lung disease”，聚焦于早期囊性纤维化（CF）肺病中的肺部急性加重问题，由Vincent Giacalone提交，机构为Mendeley，发布时间为2022年，来源站为doi.org，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。数据集围绕0至5岁CF患儿展开纵向队列研究，采集血液与支气管肺泡灌洗液样本，通过流式细胞术与20重化学发光法分析免疫细胞及免疫介质，并按肺部急性加重史对患者进行分组。整体而言，该数据集为探索CF早期肺部炎症与T细胞抑制机制提供了样本层面的研究基础，本站将其归入呼吸系统疾病/其他分类。
【数据集背景】
在慢性囊性纤维化肺病中，中性粒细胞炎症与T细胞抑制同时发生，部分原因在于中性粒细胞介导释放T细胞抑制酶Arg1。然而，这种对T细胞的持续性抑制何时开始，以及肺部急性加重对这一过程的影响，此前尚不清楚。该数据集正是针对这一未知问题而建立，研究对象为0至5岁的CF患儿，属于在Emory University开展的纵向队列研究。数据集试图通过稳定期门诊随访与急性加重住院期间的样本比较，揭示早期CF肺病中免疫抑制现象的起始及其与肺部急性加重的关系。
【数据内容】
数据集包含血液样本（n = 35）和支气管肺泡灌洗液样本（n = 18），这些样本在稳定期门诊就诊或肺部急性加重住院时采集。样本分析采用流式细胞术，用于检测免疫细胞的存在与表型；同时采用20重化学发光法检测免疫介质。患者按肺部急性加重史分为三类：无既往肺部急性加重、稳定期就诊前有肺部急性加重史、当前正处于肺部急性加重。源站描述提到，肺部急性加重与促炎和抗炎介质浓度的升高均相关，但该句在源站描述中未完整呈现，其余具体指标与结果数据未在已有信息中给出。
【采集与来源】
样本采集场景包括稳定期门诊随访和肺部急性加重住院两类。研究在Emory University开展，纳入对象为0至5岁的CF患儿。血液与支气管肺泡灌洗液样本分别按上述两种场景收集，随后进行流式细胞术和20重化学发光法分析。数据集的来源站为doi.org，提交机构为Mendeley，作者为Vincent Giacalone，发布时间为2022年。除上述信息外，样本采集的具体时间跨度、随访频率、临床中心数量等细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于早期囊性纤维化肺病中免疫机制相关的研究场景，尤其是围绕中性粒细胞炎症、T细胞抑制、Arg1介导的免疫调节以及肺部急性加重影响的研究。由于包含稳定期与急性加重期的血液和支气管肺泡灌洗液样本，并配有免疫细胞表型与免疫介质检测数据，可用于比较不同肺部急性加重史分组之间的免疫特征差异。此外，也可作为CF早期肺病纵向队列研究的参考数据，用于方法学借鉴或与其他免疫分析结果进行对照。具体适用分析类型与统计用途源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可依据患者肺部急性加重史的三分类进行分组比较，即无既往肺部急性加重、稳定期就诊前有肺部急性加重史、当前肺部急性加重。分析时可分别针对血液样本与支气管肺泡灌洗液样本，结合流式细胞术获得的免疫细胞存在与表型数据，以及20重化学发光法获得的免疫介质数据开展研究。由于样本量分别为血液n = 35、支气管肺泡灌洗液n = 18，分析时需注意两类样本的对应关系与分组分布。具体的数据文件结构、变量命名、预处理步骤与推荐分析流程源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单中心纵向队列研究，样本来自Emory University，纳入对象为0至5岁CF患儿，血液与支气管肺泡灌洗液样本量分别为35和18，样本规模有限。源站描述中关于肺部急性加重与促炎、抗炎介质浓度升高的结果表述不完整，部分结果信息缺失。数据集未提供随访时长、样本采集的具体时间点、缺失值情况以及质量控制流程等信息。此外，支气管肺泡灌洗液样本量小于血液样本量，可能影响两类样本间的对照分析。其他质量指标与限制条件源站未提供。
【引用与许可】
该数据集由Vincent Giacalone提交，机构为Mendeley，发布时间为2022年，来源站为doi.org。数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，允许在署名条件下使用与传播。引用时应注明数据集名称“Pulmonary exacerbations in early CF lung disease”、作者Vincent Giacalone、发布年份2022以及来源站doi.org。具体的引用格式、DOI标识与机构署名要求源站未提供。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.17632/rbm3ybxz54.1
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 53.6 KB。
数据说明
背景：在慢性囊性纤维化（CF）肺病中，中性粒细胞性炎症和T细胞抑制同时发生，部分原因是中性粒细胞介导释放T细胞抑制酶Arg1。然而，这种对T细胞的持续性抑制何时开始，以及肺部急性加重（PEs）对这一过程的影响，仍不清楚。方法：0-5岁CF患儿被纳入埃默里大学的一项纵向队列研究。在稳定的门诊就诊或住院PE期间采集血液（n = 35）和BAL液（n = 18），并通过流式细胞术（检测免疫细胞的存在和表型）和20重化学发光测定（检测免疫介质）进行分析。患者按PE病史分为无既往PE、稳定就诊前有PE病史或当前PE。结果：PEs与BAL中促炎和抗炎介质浓度升高以及循环中中性粒细胞频率和G-CSF增加相关。PE的BAL样本显示，先前在慢性CF中发现的过度外分泌型GRIM中性粒细胞频率呈增加趋势。
在比较支气管肺泡灌洗液（BAL）与血液样本中T细胞上T细胞受体相关分子CD3和抑制性程序性死亡-1（PD-1）受体的表达时，我们发现所有患者中CD3均显著降低，而PD-1表达普遍升高。按PE状态分类后，循环血T细胞上CD3或PD-1的表达无差异，但当前PE样本的BAL T细胞上CD3表达降低，PD-1表达升高。结论：这些数据提示，在慢性中性粒细胞性炎症发生之前的生命早期PE期间，气道T细胞即已被激活。然而，循环中中性粒细胞频率增加以及气道中GRIM中性粒细胞频率呈增加趋势，为儿童期PE可能加速气道炎症的机制提供了新的见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
