SARS-CoV-2 诱导 ARDS 幸存者蛋白质组学分析

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.8375666

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数据集大小约 338.2 KB。

数据说明

约80%继发于SARS-CoV-2感染的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者会出现持续性肺功能障碍。介导肺部后遗症和恢复的分子因素尚不清楚。在此背景下，我们试图全面描述肺弥散功能受损的蛋白质组学决定因素。这是一项前瞻性队列研究，纳入了87名SARS-CoV-2诱导的ARDS幸存者。出院后3个月进行了完整的肺功能评估和胸部计算机断层扫描（CT）。使用邻近延伸分析（PEA）技术对血浆样本进行了蛋白质组学分析（364种蛋白质）。采用偏最小二乘判别分析（PLS-DA）和随机森林（RF）方法评估预测因子的重要性。30%的患者表现为中度至重度肺弥散功能受损（D LCO <60%预计值）。在单变量分析中，15种蛋白质在D LCO <60%的患者中显示高浓度[错误发现率（FDR）<0.05]。多效蛋白（PTN）显示出最大的差异：倍数变化=2.22，FDR=0.001。

差异检测到的蛋白质与D LCO 呈反向且独立的剂量-反应关系。多变量分析方法根据弥散功能障碍的严重程度对蛋白质进行聚类。这些聚类由细胞增殖与分化、组织重塑、血管生成、凝血、炎症、免疫反应及纤维化信号通路的宿主介质组成。在SARS-CoV-2诱导的ARDS幸存者中，肺弥散功能障碍与参与多种损伤和修复机制的特定循环因子相关。宿主蛋白质特征谱有助于更好地理解肺部后遗症，并可能构成治疗靶点和生物标志物。这些观察结果的长期生物学和临床意义有待进一步研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。