Ascaris suum感染小鼠肺RNA测序数据集
研究聚焦于寄生虫感染诱导的肺部转录组响应，涉及Type-2炎症、簇细胞增生和几丁质酶样活性等特征。数据可用于分析宿主对寄生虫感染的免疫应答机制，探索呼吸系统疾病相关的基因表达变化，并支持表达谱预测与比较研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
Ascaris suum感染小鼠肺RNA测序数据集
PRJNA1460820 数据集收录的是小鼠肺部 RNA 测序数据，研究对象为感染蛔虫（Ascaris suum）的小鼠。该数据集来自 NCBI，源站标题为“RNA sequencing of lungs from Ascaris suum infected mice”，本站将其归入呼吸系统疾病 / 其他分类。源站描述指出，2 型炎症是过敏与蠕虫感染的标志性特征，该研究探索了感染蛔虫的小鼠肺部的转录组响应，感染诱导了广泛的 2 型炎症反应，包括簇细胞增生和几丁质酶样活性的特征。数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE329733_series_matrix.txt.gz，作者为 Andrew R Williams，发布时间为 May 01 202，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24247 平台与 10090 物种标识。
【数据集背景】
2 型炎症是过敏性疾病与蠕虫感染共有的重要免疫学特征。源站描述表明，该数据集所对应的研究以感染蛔虫 Ascaris suum 的小鼠为对象，关注肺部在感染后的转录组变化，旨在刻画宿主肺部对寄生虫感染的免疫应答图景。研究观察到感染诱导了广泛的 2 型炎症反应，并伴随簇细胞增生与几丁质酶样活性等标志性特征。这些内容构成了该数据集产生的生物学背景，也说明其数据可用于理解呼吸系统在寄生虫感染条件下的基因表达改变。
【数据内容】
该数据集为 RNA 测序表达谱数据，来源于小鼠肺部组织。源站描述提及的转录组响应涵盖 2 型炎症反应、簇细胞增生和几丁质酶样活性等特征。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE329733_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵文件形式。主题标签包含 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247 与 10090，分别指向高通量测序表达谱分析、芯片平台标识与小鼠物种标识。除上述信息外，样本数量、具体基因列表、表达量数值等细节源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“RNA sequencing of lungs from Ascaris suum infected mice”。作者为 Andrew R Williams，发布时间为 May 01 202。本站分类为呼吸系统疾病 / 其他。关于具体的实验设计、测序策略、样本处理与建库细节，源站未提供。
【适用场景】
依据源站描述与侧写线索，该数据可用于分析宿主对寄生虫感染的免疫应答机制，探索呼吸系统疾病相关的基因表达变化，并支持表达谱预测与比较研究。具体而言，研究者可围绕 2 型炎症、簇细胞增生与几丁质酶样活性等特征，对感染与对照条件下的肺部转录组进行比较分析。其他应用方向源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE329733_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。关于具体的分析软件、参数设置与标准化流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1，以系列矩阵文件形式提供。样本规模、测序深度、重复数、质控指标等信息源站未提供，因此无法对数据质量作出具体评估。使用时应注意其研究对象为小鼠模型，结论外推到其他物种需谨慎；其他限制条件源站未提供。
【引用与许可】
作者为 Andrew R Williams，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 May 01 202。关于数据许可条款与具体引用格式，源站未提供。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329733
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
2型炎症是过敏和蠕虫感染的标志。在此，我们探索了感染蛔虫Ascaris suum的小鼠肺部的转录组反应。感染诱导了广泛的2型炎症反应，包括簇细胞增生和几丁质酶样活性的标志。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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