PRJNA1396796:古RNA鼻病毒A基因组组装
该数据集来自 NCBI,为18至19世纪保存的人类肺标本的古RNA(aRNA)鸟枪法测序数据,旨在揭示RNA病毒基因组。系统发育分析表明该历史HRV基因组是已灭绝谱系,与当代基因型相关,可用于研究鼻病毒演化及拓展古病毒学的时间范围(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
PRJNA1396796:古RNA鼻病毒A基因组组装
该数据集来自 NCBI,为18至19世纪保存的人类肺标本的古RNA(aRNA)鸟枪法测序数据,旨在揭示RNA病毒基因组。对苏格兰格拉斯哥Hunterian博物馆馆藏肺标本GLAHM:120916(公元1743-1783年)的测序发现了aRNA读段及+ssRNA病毒Human Rhinovirus A(HRV A)的近完整基因组。系统发育分析表明该历史HRV基因组是已灭绝谱系,与当代基因型相关,可用于研究鼻病毒演化及拓展古病毒学的时间范围(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对18至19世纪保存的人类肺标本的古RNA(aRNA)进行鸟枪法测序,以揭示RNA病毒基因组。对苏格兰格拉斯哥Hunterian博物馆馆藏肺标本GLAHM:120916(公元1743-1783年)的测序揭示了aRNA读段以及一种+ssRNA病毒——Human Rhinovirus A(HRV A)的近完整基因组。系统发育分析表明,这一历史HRV基因组是一个与当代基因型相关的已灭绝谱系,为鼻病毒演化提供了独特视角。这些发现表明,数百年历史的医学标本可保留有信息量的aRNA,从而拓展了古病毒学的时间范围。
【主题与分类】
主题标签:Genome sequencing。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1396796
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1396796
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- OpenDataLab:
数据说明
对18世纪和19世纪保存的人类肺标本进行古RNA(aRNA)鸟枪法测序,以揭示RNA病毒基因组。对来自苏格兰格拉斯哥亨特博物馆的肺标本GLAHM:120916(公元1743-1783年)进行测序,发现了aRNA读段以及一种+ssRNA病毒——人鼻病毒A(HRV A)的近完整基因组。系统发育分析表明,这一历史HRV基因组是一个已灭绝的谱系,与当代基因型相关,为鼻病毒演化提供了独特视角。这些发现表明,数百年历史的医学标本可保留有信息价值的aRNA,从而拓展了古病毒学的时间范围。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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