PRJEB57116:HCA 胎儿肺 CZI RNA 数据集

据源站描述,该数据与 Marko Nikolic 合作,用于研究妊娠晚期肺和血液组织样本中基因表达与细胞异质性的变化,样本来自 UCLH 和 GOSH,项目由 CZI 儿科资助

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基因组分类Other
PRJEB57116: HCA_Lung_Foetal_CZI_RNA

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

PRJEB57116:HCA 胎儿肺 CZI RNA 数据集

PRJEB57116: HCA_Lung_Foetal_CZI_RNA 是一个与呼吸系统疾病及其他相关研究方向关联的数据集资源,收录于 ncbi.nlm.nih.gov 来源站。根据源站描述,该数据源于与 Marko Nikolic 的合作,旨在研究妊娠晚期(third trimester)肺组织和血液组织样本中基因表达与细胞异质性的变化。研究所用样本获取自 UCLH 和 GOSH 两家机构,项目在 CZI 儿科资助(CZI paediatric grant)框架下获得支持。该数据集以基因表达和细胞异质性为核心关注点,属于人类细胞图谱(HCA)相关命名体系下的肺部胎儿样本 RNA 数据资源,主题标签为 Other,本站分类归入呼吸系统疾病 / 其他。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集的形成背景是一项围绕妊娠晚期肺部与血液组织的研究合作。源站描述明确指出,该工作是与 Marko Nikolic 合作开展的,研究目标是考察妊娠晚期肺和血液组织样本中基因表达与细胞异质性的变化。项目由 CZI 儿科资助支持,属于该资助框架下的研究产出之一。数据集名称中包含 HCA_Lung_Foetal 字样,提示其与人类细胞图谱计划下的胎儿肺组织研究方向相关,同时名称中的 RNA 表明其数据内容与 RNA 层面相关。本站将其归类为呼吸系统疾病 / 其他,主题标签为 Other。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集所对应的研究内容聚焦于基因表达与细胞异质性两个层面,研究对象为妊娠晚期的肺组织和血液组织样本。数据集英文名中的 RNA 提示其数据与 RNA 相关。除上述信息外,关于样本数量、测序平台、数据文件类型、数据规模等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

源站描述说明,研究样本获取自 UCLH 和 GOSH 两家机构。样本类型为妊娠晚期的肺组织和血液组织。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于样本采集的具体时间范围、伦理审批信息、样本处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于研究与妊娠晚期肺组织和血液组织相关的基因表达变化及细胞异质性分析,也可为呼吸系统疾病 / 其他分类下的相关研究提供参考。由于数据集名称涉及胎儿肺组织与 RNA,其潜在用途与肺部发育、细胞组成异质性等研究方向相关。关于具体的适用分析类型和下游应用,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程或配套工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、质控指标、覆盖度或技术限制等方面的信息。使用时需注意,本介绍仅依据源站描述,未涉及数据本身的完整性、准确性或适用范围的具体评价。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上的相关说明。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB57116

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

与Marko Nikolic合作,研究妊娠晚期肺和血液组织样本(样本来自UCLH和GOSH)中的基因表达和细胞异质性变化。该资助由CZI儿科资助项目授予。

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