紫茎泽兰水提物通过破坏代谢和解毒通路损害猪蛔虫卵胚胎发育及感染性

该数据集来自NCBI,研究入侵植物Ageratina adenophora水提物对Ascaris suum虫卵发育的影响及其分子机制

sra
浏览 9
基因组Other
PRJDB45195: Ageratina adenophora Aqueous Extract Impairs Ascaris suum Egg embryonation and infectivity via Disruption of Metabolic and Detoxification Pathways (PRJCA061819)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-01

资源简介

紫茎泽兰水提物通过破坏代谢和解毒通路损害猪蛔虫卵胚胎发育及感染性

该数据集来自NCBI,研究入侵植物Ageratina adenophora水提物对Ascaris suum虫卵发育的影响及其分子机制。虫卵经0.10%至5.00%六个浓度体外处理,胚胎发育率呈剂量依赖性下降,5.00%处理抑制最强(34.24%),2.50%和5.00%处理组肺部病变显著减轻、幼虫数量降低。通过RNA-Seq探索关键响应通路与基因。数据可用于寄生虫卵防控、植物源杀虫剂机制及代谢与解毒通路研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Ageratina adenophora(A. adenophora)是一种全球入侵性多年生草本植物,对生物多样性构成重大威胁。然而,近期研究凸显了其生态利用潜力,展现出抗菌、抗炎和杀虫特性。关于其对Ascaris suum虫卵的影响及潜在分子机制的研究仍然有限。本研究调查了A. adenophora水提物对A. suum虫卵发育的影响,并通过RNA测序(RNA-Seq)探索了关键响应通路和基因。A. suum虫卵在体外用不同浓度(0.10%、0.25%、0.50%、1.00%、2.50%、5.00%)的提取物处理。胚胎发育率呈剂量依赖性下降,5.00%处理显示出最强抑制(34.24%)。用2.50%和5.00%提取物处理的虫卵引起的肺部病变严重程度显著降低,幼虫数量更低。

【主题与分类】

主题标签:Other。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB45195

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB45195

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

紫茎泽兰(Ageratina adenophora,A. adenophora)是一种全球性入侵的多年生草本植物,对生物多样性构成重大威胁。然而,近期研究凸显了其生态利用潜力,展现出抗菌、抗炎及杀虫特性。关于其对猪蛔虫(Ascaris suum)虫卵作用及其潜在分子机制的研究仍较为有限。本研究探讨了紫茎泽兰水提物对猪蛔虫虫卵发育的影响,并通过RNA测序(RNA-Seq)探究了关键响应通路和基因。猪蛔虫虫卵在体外经不同浓度(0.10%、0.25%、0.50%、1.00%、2.50%、5.00%)的提取物处理。胚胎发育率呈剂量依赖性下降,其中5.00%处理组抑制效果最强(34.24%)。经2.50%和5.00%提取物处理的虫卵在感染小鼠中引起的肺部病变显著较轻,幼虫计数较低,表明感染力降低。对对照组(WH)、0.10%(EH)和0.50%(MH)处理组虫卵的转录组分析分别鉴定出EH vs. WH和MH vs. WH的281个和1083个差异表达基因(DEGs)。

GO和KEGG富集分析显示,差异表达基因(DEGs)主要参与跨膜转运、催化活性、碳水化合物代谢过程、药物代谢-细胞色素P450通路以及糖酵解/糖异生。关键基因包括CYP44A1、CYP4V2、CYP4C3和GST-4均显著下调。qRT-PCR验证了RNA-Seq结果。这些发现表明,紫茎泽兰提取物可抑制蛔虫卵发育,其机制可能是通过干扰能量代谢和外源物质解毒通路实现的。本研究为开发针对蛔虫卵阶段的紫茎泽兰基制剂提供了理论依据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。