多溶原性放大细菌病原体体内竞争力

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aa5627899d7a3d0bac62ce20ae96a718148c3454fb1fd7c0f073e2faf45bbbdf0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

下一代测序技术的兴起正揭示出微生物群落中温带噬菌体隐藏的多样性。尽管其中少数噬菌体已得到充分表征，但对于绝大多数噬菌体而言，噬菌体携带的作用，尤其是多重噬菌体携带的作用，仍知之甚少。铜绿假单胞菌利物浦流行株是囊性纤维化肺部感染中的一种侵袭性病原体，最近发现其基因组中含有若干独特的原噬菌体。在此，我们利用昆虫感染模型，在体内实验研究了其中两种噬菌体的作用。我们发现，虽然在单一细菌感染中噬菌体携带并未带来益处，但在混合感染中，噬菌体通过介导细菌间的竞争赋予了很大的适合度优势。两种噬菌体之间的差异似乎与竞争者获得噬菌体的速率相关，因而也与抗性相关。然而，这种优势在……中最为显著。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。