铜绿假单胞菌长期囊性纤维化气道感染高毒力亚群数据

该数据集来自 Dryad,对应一项关于铜绿假单胞菌在慢性囊性纤维化气道感染中高毒力亚群的研究。数据可用于研究慢性感染中毒力性状的维持、公共物品分泌物的患者内多样性,以及表型变异与急性毒力之间的关系(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)

DryadDryad
dryad
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基因组分类pyoverdineVirulenceLiverpool epidemic strainCystic fibrosispyocyaninLasA proteaseGalleria mellonellapublic goods secretions
Data from: High virulence sub-populations in Pseudomonas aeruginosa long-term cystic fibrosis airway infections

基本信息

模态
基因组
大小
0.000114541 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-13

资源简介

铜绿假单胞菌长期囊性纤维化气道感染高毒力亚群数据

Data from: High virulence sub-populations in Pseudomonas aeruginosa long-term cystic fibrosis airway infections

该数据集来自 Dryad,对应一项关于铜绿假单胞菌在慢性囊性纤维化气道感染中高毒力亚群的研究。数据聚焦 Liverpool epidemic strain,量化患者体内三种毒力相关分泌物(pyoverdine、pyocyanin、LasA protease)的变异,并考察这种表型多样性对昆虫宿主模型 Galleria mellonella 急性感染毒力的影响。数据可用于研究慢性感染中毒力性状的维持、公共物品分泌物的患者内多样性,以及表型变异与急性毒力之间的关系(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2018。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:铜绿假单胞菌通常在慢性囊性纤维化感染过程中表现出毒力相关分泌物的丢失。这导致人们提出,毒力在慢性感染中是一种高代价属性。然而,既往报道提示,过量产生(OP)毒力致病型可与不产生突变体在 CF 肺中共存多年。这种患者内表型多样性对该病原体成功的影响尚未被完全理解。在此,我们对铜绿假单胞菌 Liverpool 囊性纤维化流行株中三种毒力相关分泌物的宿主内变异进行了深入量化,并研究了这种表型变异对昆虫宿主模型急性感染中毒力的影响。结果:所有三种分泌物(pyoverdine、pyo

【主题与分类】

主题标签:pyoverdine、Virulence、Liverpool epidemic strain、Cystic fibrosis、pyocyanin、LasA protease、Galleria mellonella、public goods secretions。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.p7d03

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 114.5 KB。

数据说明

背景:铜绿假单胞菌在慢性囊性纤维化感染过程中通常表现出毒力相关分泌物的丢失。这引发了这样一种观点,即在慢性感染中,毒力是一种代价高昂的属性。然而,此前的报告表明,过量产生(OP)毒力的致病型可以与不产生的突变体在CF肺中共存多年。这种患者体内表型多样性对该病原体成功的影响尚未完全明了。在此,我们深入量化了利物浦囊性纤维化流行株铜绿假单胞菌中三种毒力相关分泌物产生的宿主内变异,并研究了这种表型变异对昆虫宿主模型急性感染中毒力的影响。结果:所有三种分泌物(pyoverdine、pyocyanin和LasA蛋白酶)均存在患者内变异。在采样的三名患者中的两名中,OP分离株与低产生突变体共存。在第三名患者中,所有39个分离株相对于可传播祖先LESB58而言,均为所有三种分泌物的低产生者。

最后,这种表型变异转化为昆虫宿主模型中毒力的变化。结论:铜绿假单胞菌毒力相关分泌物产生的种群内变异可导致高毒力亚群在慢性囊性纤维化感染患者中持续存在。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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