Plexin D1 作为 PM/DM 潜在生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05637931

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：多发性肌炎、皮肌炎。多发性肌炎（PM）和皮肌炎（DM）是主要累及肌肉的自身免疫性炎症性疾病。自身免疫性皮肌炎（DM）是一种罕见的炎症性疾病，主要累及皮肤、肌肉和肺。炎性肌病（IMs）常具有独特的组织病理学特征，提示皮肌炎（DM）中存在体液介导的微循环受累，包括补体C5b-9膜攻击复合物（MAC）在毛细血管的早期沉积及继发性缺血性改变；以及多发性肌炎（PM）和包涵体肌炎中由CD8 T细胞介导、MHC1限制性的自身免疫性肌纤维攻击。Plexins是一个保守的大型蛋白家族（约200kDa），是semaphorin分子的经典受体。Plexins分为A至D四类。近年来，plexin和semaphorin分子已被证明在免疫系统中调控细胞运动和细胞间相互作用。细胞外囊泡（EVs）是存在于多种体液中的脂质双层膜囊泡。

细胞外囊泡由正常细胞、病变细胞和转化细胞在体外和体内释放，能够携带脂质、蛋白质、mRNA、非编码RNA甚至DNA。它们在血清和血浆中含量丰富，作为潜在的疾病生物标志物引起了广泛关注。通常情况下，它们通过向邻近细胞传递生物信息并促进细胞间通讯来维持生理功能，但也参与多种自身免疫性疾病的发病机制。LC/MS分析在血清细胞外囊泡中鉴定出1220种蛋白质。其中，plexin D1在PM/DM患者的细胞外囊泡中富集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。