NanoString自身免疫谱面板归一化线性计数及统计分析汇总
该数据集来自search.dataone.org，包含NanoString自身免疫谱面板的归一化线性计数及统计分析汇总，用于研究吸入性结晶二氧化硅（cSiO2）与DHA在NZBWF1狼疮易感小鼠中的效应
基本信息
资源简介
NanoString自身免疫谱面板归一化线性计数及统计分析汇总
NanoString autoimmune profiling panel normalized linear counts and summary of statistical analyses
该数据集来自search.dataone.org，包含NanoString自身免疫谱面板的归一化线性计数及统计分析汇总，用于研究吸入性结晶二氧化硅（cSiO2）与DHA在NZBWF1狼疮易感小鼠中的效应。数据覆盖成熟成年雌性小鼠经饮食（对照或DHA）和鼻内滴注（生理盐水或cSiO2）后的自身免疫相关基因表达谱，可用于探索cSiO2暴露触发自身免疫及DHA保护作用的分子机制（来源 DataONE，CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：职业暴露于可吸入结晶二氧化硅（cSiO2）与狼疮的发生有关。临床前研究表明，年轻（8-11周龄）雌性NZBWF1狼疮易感小鼠每周重复鼻内暴露于1 mg cSiO2（相当于12-20岁人类生命阶段），会触发肺和肾脏的自身免疫，而膳食补充omega-3脂肪酸二十二碳六烯酸（DHA）可预防该过程。方法：在此，我们在成熟成年（16-19周龄）雌性NZBWF1小鼠中表征了cSiO2和DHA的作用，该年龄段与免疫耐受破坏的开始相吻合，且更能代表cSiO2暴露工人的年龄（>20岁）。我们给小鼠喂食对照饮食（CON）或添加了DHA的饮食，其热量相当于人类每日5克剂量。2周后，我们鼻内滴注生理盐水载体（V
【主题与分类】
主题标签：Docosahexanoic acid (DHA)、life stage、crystalline silica、Systemic lupus erythematosus、ectopic lymphoid tissue、autoantibody、NZBWF1 mice、Omega fatty acid。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3A9968c502734c931c38c337d2234149e82cff88e3ffabcfe44952fc7c88aba5e0
使用许可：CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
职业性接触可吸入结晶二氧化硅（cSiO2）与狼疮的发生有关。临床前研究显示，年轻（8-11周龄）雌性NZBWF1狼疮易感小鼠每周重复经鼻暴露于1 mg cSiO2（该生命阶段相当于人类12-20岁），会触发肺和肾脏的自身免疫反应，而通过膳食补充omega-3脂肪酸二十二碳六烯酸（DHA）可预防该反应。方法：在本研究中，我们表征了cSiO2和DHA对成熟成年（16-19周龄）雌性NZBWF1小鼠的影响，该年龄段与免疫耐受破坏的发生时间相吻合，且更能代表cSiO2暴露工人的年龄（>20岁）。我们给小鼠喂食对照饮食（CON）或添加了DHA的饮食，其热量相当于人类每日5 g的剂量。2周后，我们每周经鼻滴注生理盐水载体（VEH）或1 mg cSiO2，持续4周。各队列分别在末次滴注后1周和5周终止……，使用RNeasy Mini试剂盒并经DNase处理（Qiagen，Valencia，CA）从肺组织（滴注后1周和5周）中提取RNA。
RNA溶解于无核酸酶水中，使用Qubit（Thermo Fisher Scientific）进行定量，并使用TapeStation（Agilent Technologies）验证完整性。样品（RNA完整性>8）在MSU Genomics Core使用NanoString自身免疫基因表达检测（XT-CSO-MAIP1-12，NanoString Technologies，Seattle，WA）进行分析。检测按照制造商说明在nCounter MAX系统、样品制备站和数字分析仪（NanoString Technologies）上进行并定量。基因表达数据按先前描述的方法进行分析。简言之，原始基因表达数据使用NanoString的软件nSolver v3.0.22及Advanced Analysis Module v2.0进行分析。对于差异基因表达，基因表达的统计学显著差异定义为表达变化1.5倍（log2 >0.58或<-0.58）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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