基于RNA测序数据针对COPD患者的多中心韩国队列研究
该数据集来自omicsdi.org,为基于RNA测序数据、针对COPD患者的多中心韩国队列研究。研究自2020年起前瞻性收集三家医院呼吸内科门诊吸烟者的肺功能检查结果与全血样本,采用高通量RNA测序分析外周血基因表达变化,并通过RNA-Seq转录组分析确认COPD患者非编码RNA表达差异与气流受限程

基本信息
资源简介
基于RNA测序数据针对COPD患者的多中心韩国队列研究
该数据集是一项基于RNA测序数据、针对COPD患者开展的多中心韩国队列研究,来源于omicsdi.org,归入呼吸系统疾病/其他类别,主题标签为转录组学。研究采用高通量RNA测序技术,分析吸烟者外周血的基因表达变化,以确定参与COPD发生发展的表达改变。研究自2020年起前瞻性收集三家医院呼吸内科门诊吸烟者的肺功能检查结果与全血样本,通过RNA-Seq转录组分析确认了COPD患者中非编码RNA表达差异与气流受限程度之间的关系。这些结果可为未来COPD研究提供有价值的预测资源。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发生发展与吸烟等环境暴露密切相关,但其分子层面的表达改变仍需借助高通量手段加以刻画。该研究聚焦吸烟人群,旨在确定哪些基因表达变化参与COPD的发生发展。研究设计为多中心韩国队列,自2020年起在前瞻性框架下纳入受试者,通过外周血RNA测序获取转录组信息,并结合肺功能检查结果进行分析,从而在人群队列层面考察COPD相关的表达特征。
【数据内容】
该数据集的核心内容为基于高通量RNA测序获得的外周血基因表达数据,研究对象为COPD患者及吸烟者。研究通过RNA-Seq转录组分析,确认了COPD患者中非编码RNA的表达差异,并考察了这些差异与气流受限程度之间的对应关系。数据主题归类为转录组学,所属分类为呼吸系统疾病/其他。除上述转录组与肺功能相关信息外,源站未提供关于样本量、具体基因列表、数据文件格式与规模的进一步说明。
【采集与来源】
数据采集具有前瞻性与多中心特征。自2020年起,研究者在三家医院的呼吸内科门诊连续收集就诊吸烟者的肺功能检查结果与全血样本,随后对全血样本中的总RNA进行测序分析。数据来源站为omicsdi.org。受试者来源限定为上述三家医院呼吸内科门诊的吸烟就诊者,采集内容涵盖肺功能检查结果与全血样本两类。关于各中心的具体名称、地理分布及伦理审批信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于COPD相关的转录组学研究,尤其是围绕吸烟人群外周血基因表达变化的探索性分析。其典型用途包括:考察COPD患者与非COPD吸烟者之间的基因表达差异;分析非编码RNA在COPD中的表达特征;研究非编码RNA表达差异与气流受限程度之间的关联;以及作为未来COPD预测性研究的外部参照或验证资源。由于研究采用多中心前瞻性队列设计,亦可为跨中心的表达模式比较提供素材。具体分析场景的可行性仍需结合源站未提供的样本量与数据格式等信息判断。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕外周血RNA测序表达数据与配套的肺功能检查结果展开分析,将表达谱按COPD状态与气流受限程度进行分组比较,重点关注非编码RNA的表达差异。分析中宜考虑多中心来源可能带来的批次效应,并在具备条件时进行中心间一致性评估。由于源站未提供数据访问方式、文件格式与预处理流程,具体下载、质控与标准化步骤需以源站说明为准。
【质量与限制】
该研究的优势在于前瞻性、多中心设计与RNA测序的高通量特性,并同步采集肺功能检查结果,使表达数据可与临床表型对应分析。其限制在于:源站未提供样本量、测序深度、数据完整性与缺失情况等信息;研究对象限定为韩国吸烟人群,外推至其他人群时需谨慎;数据仅涉及外周血转录组,未涵盖其他组织或更多组学层面。此外,源站未提供质控标准与数据版本信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可条款。使用者在引用与再分发前,应查阅omicsdi.org上该数据集的原始页面以获取正式引用信息与使用许可。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE240656
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为确定导致吸烟者发生COPD的基因表达变化,采用高通量RNA测序技术检测COPD患者外周血。通过前瞻性收集自2020年以来在三家医院呼吸内科门诊就诊的吸烟者的肺功能检查结果和全血样本,进行总RNA测序研究。本研究通过RNA-Seq转录组分析,证实了COPD患者非编码RNA基因表达随气流受限程度的不同而存在差异。这些结果可能为未来的COPD研究提供有价值的预测资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




